甘薯近缘野生种ISBP分子标记的开发及其在遗传多样性分析和品种鉴定中的应用

文献类型： 中文期刊

第一作者： 孟羽莎

作者： 孟羽莎;王寅;赖齐贤;刘雷;项超;吴永华;郑嫣然;顾兴国;方豪;苗苗;吴列洪;汤勇

作者机构：

关键词： 甘薯;ISBP;LTR;分子标记;遗传多样性;品种鉴定

期刊名称： 浙江农业学报

ISSN： 1004-1524

年卷期： 2023 年 003 期

页码： 489-498

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 从甘薯近缘野生种Ipomoea triloba和Ipomoea trifida的基因组测序序列中鉴定出2 360条长末端重复反转座子（long terminal repeat retrotransposons, LTR-RT）序列，在此基础上开发了100对基于插入位点的多态性（insertion-site-based polymorphisms, ISBP）引物，并利用4份甘薯种质资源对开发的ISBP引物进行多态性评估，发现24对ISBP引物具有较高的多态性，随后将其应用于浙江省收集的56份甘薯种质资源的遗传多样性分析和品种鉴定。结果显示，24对ISBP引物在56份种质资源中共产生182条多态性条带，且每份种质资源都有独特的指纹信息。NTsys遗传分析结果显示，群体内不同种质资源之间的遗传距离从0.027 5至0.653 8,平均为0.373 2,引物多态性信息含量（polymorphic information content, PIC）平均为0.289 6,UPGMA和PCA结果显示，这些群体共被分为两个大群，分别包含11和45份种质资源。以上研究表明，该群体的遗传变异较小，不同种质资源之间的遗传背景狭窄。本研究开发的ISBP引物一方面增加了甘薯中逆转座子分子标记的数量，填补了ISBP标记在甘薯遗传分析中应用的空白，另一方面为甘薯品种资源鉴定、保护与利用提供了有力工具。

分类号： S531

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