基于转录组分析植物激素对洋葱鳞茎膨大发育的调控机制
文献类型: 中文期刊
第一作者: 李艳伟
作者: 李艳伟;杨妍妍;孙亚玲;霍雨猛;王振宝;刘冰江
作者机构:
关键词: 洋葱;鳞茎膨大;转录组分析;植物激素;转录因子
期刊名称: 生物技术通报
ISSN: 1002-5464
年卷期: 2025 年 41 卷 002 期
页码: 187-201
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 【目的】通过对洋葱发育不同阶段的鳞茎组织进行转录组比较分析,为研究植物激素在洋葱鳞茎形成过程中的分子调控机制提供依据。【方法】分别取洋葱出苗后33、47、61和75 d的鳞茎部位为试验材料,通过酶联免疫吸附法和气相色谱法检测,了解生长素、细胞分裂素、赤霉素3、脱落酸以及乙烯(前体ACC)含量在鳞茎膨大过程中的变化趋势;利用高通量测序技术进行转录组测序分析,从分子水平阐述植物激素对鳞茎发育的影响。【结果】从4个发育阶段的鳞茎中共检测到11 814个差异表达基因(DEGs),其中共同DEGs有3 311个;KEGG富集分析显示,不同发育阶段比较组DEGs均显著富集到“植物激素信号转导”通路,并对该通路上筛选到的36个主要DEGs进行表征;结合WGCNA分析每个模块与性状的r和P值,筛选到2个关键模块,通过转录因子预测,挖掘到3 028个转录因子unigenes与13个植物激素信号结构基因unigenes共表达,转录因子unigenes功能注释来自46个基因家族,最多的为锌指蛋白(C2C2、C3H),其次为bHLH、NAC、ERF基因家族。【结论】通过转录组分析揭示了植物激素信号转导途径参与洋葱鳞茎膨大发育的相关基因。
分类号: S633.2
- 相关文献
[1]转录组分析筛选调控苹果分枝能力的关键基因. 张海青,张恒涛,高启明,姚家龙,王亚荣,刘珍珍,孟祥鹏,周喆,阎振立. 2024
[2]陆地棉幼苗NaCl胁迫下转录因子的转录组学分析. 彭振,杜雄明,卢艳丽. 2017
[3]杜鹃花品种大鸳鸯锦花瓣条纹形成的色素基础和差异表达基因的挖掘. 孙晓波,郭臻昊,李畅,周惠民,刘晓青,苏家乐. 2023
[4]紫花苜蓿不同发育时期次生壁合成调控的转录组分析. 刘希强,张涵,龚攀,宫文龙,王赞. 2018
[5]低磷胁迫下高羊茅转录组学分析. 马培杰,李亚娇,舒健虹,王子苑,罗维,龙忠富,王小利. 2025
[6]基于转录组的洋葱bHLH转录因子家族鉴定与生物信息学分析. 陈微,潘美红,惠林冲,李威亚,郇国磊,何林玉,缪美华,陈振泰,杨海峰. 2023
[7]辣椒乙烯反应转录因子基因CaJERF1的克隆及诱导表达. 张秋平,杨宇红,茆振川,陈国华,谢丙炎. 2012
[8]响应低磷胁迫大豆miRNA的鉴定. 沙爱华,巴红平,单志慧,张晓娟,吴学军,邱德珍,陈水莲,周新安. 2012
[9]低磷条件下植物根系形态反应及其调控机制. 陈磊,王盛锋,刘自飞,刘荣乐,汪洪. 2011
[10]植物激素在茶树应对非生物逆境中的作用研究进展. 李梦菡,吉艳艳,张丽平,葛诗蓓,韩文炎,李鑫. 2022
[11]赤霉素和细胞分裂素对石蒜鳞茎膨大的调控作用及其生理机制. 许俊旭,李青竹,杨柳燕,李心,王桢,杨贞,张永春. 2019
[12]不同发育期大蒜鳞茎膨大相关农艺性状的观测. 刘秀慧,李锡香,王海平,沈镝,宋江萍,邱杨,张晓辉. 2015
[13]石蒜鳞茎膨大过程中碳水化合物代谢相关基因的差异表达研究. 许俊旭,李青竹,李叶,杨柳燕,张永春,蔡友铭. 2021
[14]不同发育期大蒜植株生长和鳞茎膨大相关农艺性状的动态研究. 刘秀慧,李锡香,王海平,宋江萍,邱杨,张晓辉. 2017
[15]石蒜属植物鳞茎发育机理及调控研究进展. 许俊旭,李青竹,杨柳燕,李心,王桢,张永春. 2021
[16]百合鳞茎发育过程中淀粉合成相关酶基因的克隆及表达分析. 张进忠,孙嘉曼,李朝生,韦莉萍,范燕萍. 2019
[17]基于RNA-Seq技术的盐胁迫向日葵转录组信息分析. 孙瑞芬,张艳芳,郭树春,于海峰,李素萍,聂惠,乔慧蕾,安玉麟. 2015
[18]旱柳转录组测序及生物学分析. 李敏,郭聪,李玉娟,冯新民,王莹,张健,谈峰. 2019
[19]玉米矮秆突变体A2的表型鉴定及转录组分析. 董春林,翟广谦,张正,杨睿,张明义,张彦琴,杨丽莉,常建忠. 2019
[20]基于转录组挖掘蕉城苦茶苦茶碱合成相关基因. 陈潇敏,王鹏杰,王淑燕,杨如兴,孙君,郭永春,陈雪津,赵峰,叶乃兴. 2021
作者其他论文 更多>>
-
‘大金钩’韭菜消费评价调查及产业发展建议
作者:舒锐;李朝霞;李晓龙;许念芳;孙亚玲;霍雨猛;纪晓燕;付在秋
关键词:韭菜;消费评价;调查研究
-
基于BSA方法的瓠瓜果形相关性状主效QTL分析
作者:穆子涵;吴晓花;李艳伟;鲁忠富;王尖;吴新义;汪宝根;王华森;李国景;汪颖
关键词:瓠瓜;果形;BSA-seq;SNP-index
-
基于KASP标记快速鉴定瓠瓜杂种F1纯度的方法
作者:冯子珊;吴晓花;李艳伟;鲁忠富;王尖;吴新义;汪宝根;叶子弘;李国景;汪颖
关键词:瓠瓜;KASP标记;纯度鉴定;快速;浙蒲9号
-
不同浓度NaCl胁迫对洋葱种子发芽的影响
作者:徐子龙;刘波;李艳伟;王振宝;霍雨猛;刘冰江;孙秀东
关键词:NaCl胁迫;洋葱;种子发芽;盐害系数
-
植物组培抗菌剂PPM对萝卜种子消毒及无菌苗生长的影响
作者:孙亚玲;刘辰;刘贤娴;牛蕴华;何启伟;霍雨猛;徐文玲
关键词:萝卜;种子消毒;植物组培抗菌剂;无菌苗
-
洋葱种子消毒和无菌苗培养新方法
作者:孙亚玲;李瑞平;王振宝;张庶;刘冰江;霍雨猛
关键词:洋葱;种子;消毒;无菌苗;植物组培抗菌剂(PPM)
-
基于干种子DNA的洋葱杂交种纯度分子标记快速鉴定
作者:孙亚玲;李艳伟;王振宝;吴雄;刘冰江;杨妍妍
关键词:洋葱;种子;DNA提取;纯度;快速鉴定
