基于表达谱芯片挖掘清远麻鸡和科宝肉鸡比目鱼肌差异表达基因

文献类型： 中文期刊

第一作者： 束婧婷

作者： 束婧婷;章明;宋迟;单艳菊;徐文娟;宋卫涛;李慧芳

作者机构：

关键词： 肌纤维性状;表达谱芯片;差异表达基因;清远麻鸡;科宝肉鸡

期刊名称： 畜牧兽医学报

ISSN： 0366-6964

年卷期： 2016 年 47 卷 01 期

页码： 25-33

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 对生长速度长期的高压选择导致了快大型肉鸡与优质型地方鸡显著的表型差异,本研究旨在研究这种表型差异的分子遗传机理。采用Agilent鸡全基因组表达谱芯片对达到性成熟的优质型清远麻鸡(112d)和快大型科宝肉鸡(42d)比目鱼肌中与肌纤维发育和类型组成相关的候选基因及信号通路进行系统筛查。结果,芯片分析共筛选到差异倍数在2倍及以上的基因1 318个,以科宝肉鸡作为参照,清远麻鸡中上调基因501个,下调基因817个,主要涉及到肌肉发育、能量代谢、脂质代谢等生物学过程。基于KEGG Pathway分析发现,差异基因除了参与肌纤维发育和分化相关信号通路(如Hedgehog信号通路和Ca2+信号通路)外,Wnt信号通路,mTOR信号通路,MAPK信号通路,ErbB信号通路、JAK-STAT信号通路等一些跟能量代谢相关的信号通路也被富集为显著的信号通路。与能量代谢相关的信号通路和与肌肉发育相关的信号通路相互作用形成一个调控网络从而影响肌纤维的发育,筛选出了20个在肌纤维生长发育及分化过程中可能具有重要影响的候选基因,但这些差异表达基因在肌纤维的发育和分化过程中的作用尚待深入研究。

分类号： S831

  • 相关文献

[1]不同类型鸡趾长伸肌中基因表达谱差异分析. 章明,束婧婷,屠云洁,姬改革,单艳菊,盛中伟,张笛,邹剑敏. 2016

[2]北京油鸡的肌肉组织学特性分析. 安建勇,秦会杰,陈思睿,郑江霞,杨宁. 2013

[3]鸡CSRP3基因编码区SNPs及其与肌纤维性状的相关分析. 单艳菊,姬改革,邹剑敏,章明,屠云洁,刘一帆,巨晓军,束婧婷. 2020

[4]次黄嘌呤核苷酸脱氢酶对猪链球菌2型GN061215生物学特性及蛋白质表达的影响. 周俊明,何孔旺,倪艳秀,张雪寒,杨志彪,祝昊丹,温立斌,俞正玉,茅爱华,吕立新. 2013

[5]草菇耐低温突变菌株Vtlt-1和原始菌株V23转录组差异的研究. 吕贝贝,于海龙,祝子坪,蒋玮,何建华,吴潇,李鹏,王金斌,武国干. 2015

[6]皖系长毛兔不同周龄Wnt10b、SFRP2基因在皮肤中的表达规律. 孙露露,石福岳,秦立志,万小颖,赵辉玲,吴信生. 2013

[7]表达谱芯片技术在动物胚胎发育研究中的应用进展. 吴伟伟,宫平,哈尼克孜,石晓雷,于丽娟,徐新明,田月珍,田可川. 2013

[8]利用RNAi和表达谱芯片分析日本血吸虫Sj34.9基因的功能. 刘萍萍,石艳丽,杨云霞,刘金明,林矫矫,金亚美. 2012

[9]烟粉虱不同发育阶段解毒代谢酶基因的特异性表达. 杨妮娜,张友军,杨鑫,黄大野,龙同,万鹏. 2016

[10]干旱胁迫下杂草稻和栽培稻根系基因表达差异研究. 丁国华,孙健,杨光,张凤鸣,白良明,孙世臣,姜树坤,王彤彤,郑洪亮,夏天舒,沈希宏,马殿荣,陈温福. 2016

[11]次黄嘌呤核苷酸脱氢酶对猪链球菌2型ZY05719基因转录谱的影响. 周俊明,何孔旺,倪艳秀,祝昊丹,俞正玉,茅爱华,吕立新. 2017

[12]固氮斯氏假单胞菌全基因组测序和表达谱初步分析. 燕永亮,杨剑,窦岳坦,何升,李红权,平淑珍,彭俊平,王忆平,金奇,林敏. 2006

[13]基于表达谱芯片筛选鸡不同部位皮肤组织差异表达基因. 姬改革,束婧婷,单艳菊,章明,屠云洁,刘一帆,巨晓军,邹剑敏. 2018

[14]基于表达谱芯片挖掘鸡骨骼肌不同类型肌纤维的差异表达基因. 束婧婷,姬改革,单艳菊,章明,肖芹,屠云洁,盛中伟,张笛,邹剑敏. 2017

[15]水稻赤霉素缺失突变体gid2-1的基因表达谱芯片数据分析. 刘建军,赵瑜,鲁琳,胡月新,刘慰华. 2014

[16]利用表达谱芯片分析水稻籼粳交杂种优势的分子基础. 牛付安,曹黎明,储黄伟,程灿,周继华,罗小金,顾永平,袁勤,罗忠永. 2015

[17]混合油脂对清远麻鸡胸肌脂肪酸组成的影响及其代谢组机制研究. 苟钟勇,崔小燕,范秋丽,李龙,林厦菁,王一冰,蒋守群,蒋宗勇. 2020

[18]复合维生素对林下养殖模式下清远麻鸡肌肉品质与谷氨酸、肌苷酸及肌内脂肪含量的影响. 王一冰,严霞,孙建新,郑经成,何国戈,葛影影,张帝,蒋守群. 2021

[19]发酵柑橘渣对90～120日龄清远麻鸡营养物质表观消化率、血清生化指标以及盲肠微生物数量和臭气物质排放的影响. 杨攀,唐延天,李贞明,马现永,罗志辉,黄伟文,余苗. 2024

[20]清远麻鸡成纤维细胞库构建及生物学研究. 关伟军,马月辉,梁海青,于太永,张海艳. 2005

作者其他论文 更多>>

微信小程序