广西西番莲产区东亚西番莲病毒的发生情况及其遗传多样性分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 张莉娟

作者： 张莉娟;时鹏涛;丁孝宇;宋奇琦;莫干辉

作者机构：

关键词： 西番莲;EAPV;遗传多样性;广西

期刊名称： 西南农业学报

ISSN： 1001-4829

年卷期： 2025 年 38 卷 004 期

页码： 746-756

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： [目的]调查广西西番莲产区东亚西番莲病毒(East Asian passiflora virus,EAPV)发生情况,分析病毒种群遗传结构特征,为明确该病毒在田间的流行规律及制定防控策略提供参考依据.[方法]从广西13个市的西番莲主产区采集187份疑似被EAPV感染的西番莲样品,利用RT-PCR和核苷酸序列比对分析对样品进行鉴定.选取具有地域代表性的EAPV阳性样本,基于完整的外壳蛋白(Coat protein,CP)基因序列,分析其序列相似性、遗传多样性、遗传变异、种群结构等特征.[结果]经RT-PCR验证,共有132份西番莲样品为EAPV阳性,检出率为70.6%.从EAPV阳性样品中测序获得23株EAPV CP基因序列,上传至GenBank获得登录号.23株EAPV分离株的CP基因核苷酸序列和氨基酸序列相似性分别为80.9%~100.0%和83.4%~100.0%.系统发育进化树分析表明,23株EAPV分离株分别属于AO株系(8个分离株)和IB株系(15个分离株).IB株系CP蛋白编码区第87~95位核苷酸比AO株系多9个核苷酸.遗传差异分析结果显示,EAPV两个株系间遗传分化显著.基因交流结果显示,2个株系间基因交流频率低,株系间易发生遗传漂变.遗传多样性分析结果表明,AO株系和IB株系的基因进化主要受负选择压力,2个株系处于扩张趋势.[结论]EAPV在广西西番莲主产区发生普遍.本研究获得的23个EAPV分离株包含AO株系和IB株系.遗传漂变和负选择压力是影响EAPV遗传变异的重要机制.

分类号： S436.67

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