棉花CML基因家族成员鉴定与功能分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 杨秀

作者： 杨秀;许艳超;杨芳芳;蔡小彦;侯宇清;王玉红;王星星;王坤波;刘方;周忠丽

作者机构：

关键词： 棉花;类钙调素蛋白;盐胁迫;病毒诱导基因沉默;基因功能

期刊名称： 棉花学报

ISSN： 1002-7807

年卷期： 2019 年 004 期

页码： 307-318

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： [目的]类钙调素(Calmodulin-like,CML)蛋白是1种重要的Ca2+传感器,在调节植物应激反应机制中起重要作用.对CML基因家族进行全基因组学分析,以便深入研究CML基因在棉花逆境胁迫下的作用.[方法]利用生物信息学的方法进行了棉花CML家族成员的鉴定.利用转录组数据和反转录聚合酶链式反应分析陆地棉(Gossypium hirsutum L.)CML基因在盐胁迫下的表达模式.利用病毒诱导基因沉默技术对Gh CML44-2基因进行沉默并进行功能验证.[结果]在陆地棉(Gossypium hirsutum L.)、雷蒙德氏棉(G. raimondii Ulbrich)、亚洲棉(G. arboreum L.)中分别获得了154个、74个、78个CML蛋白.进化树和保守基序分析表明,GhCML蛋白分为8个亚类,都含有保守的EF-hand结构域;在盐胁迫下,107个Gh CML基因在叶和根中有显著的差异表达,且在根和叶中的差异表达模式不同.启动子分析表明,这些基因启动子中存在多种不同的胁迫响应元件;利用病毒诱导基因沉默技术成功沉默Gh CML44-2的棉株相较于对照更加不耐盐.[结论]该研究结果有助于了解棉花CML基因家族的进化与功能,为后续研究其功能提供了一定的理论依据.

分类号： S562

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