基于重测序的槟榔InDel标记开发及应用

文献类型： 中文期刊

第一作者： 齐兰

作者： 齐兰;杨耀东;黄丽云;杨玉娟;尹永梅

作者机构：

关键词： 槟榔;基因组重测序;InDel标记;遗传多样性

期刊名称： 分子植物育种

ISSN：

年卷期： 2024 年 005 期

页码： 1501-1507

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 槟榔是海南重要的热带特色经济作物，栽培品种‘热研一号’全基因组已经公布，为InDel标记的开发提供研究基础。本研究利用果实为长椭圆形的槟榔材料的重测序数据与参考基因组序列比对，在1号染色体上选取42个In Del位点设计引物，筛选出16对多态性好的引物对24份槟榔种质资源进行遗传多样评价，每个标记的信息多样性（PIC）值变幅为0.115 0～0.414 5，平均值0.325 8，进行聚类分析，在遗传相似系数0.64处将供试材料分为3组，一份来自云南的卵形果单独聚类为第Ⅲ组，来自台湾的2份资源与斯里兰卡的3份材料聚类为一个分支，大部分材料划分到第Ⅱ组，均为来自海南的栽培品种，表明国外收集引进的资源拓宽了海南栽培槟榔的遗传基础。本研究开发的InDel标记能有效地揭示不同材料间的遗传距离，反映种质资源之间的亲缘关系，将来可有效应用于遗传连锁图谱构建、关联分析等方面的研究。

分类号： S792.91

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