奥利亚罗非鱼与尼罗罗非鱼rDNA内转录间隔区序列特征

文献类型： 中文期刊

第一作者： 陈雪峰

作者： 陈雪峰;李红霞;俞菊华;唐永凯;李建林

作者机构：

关键词： 奥利亚罗非鱼;尼罗罗非鱼;内转录间隔区;序列特征;种质鉴定

期刊名称： 动物学杂志

ISSN： 0250-3263

年卷期： 2009 年 44 卷 02 期

页码： 94-98

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 核糖体DNA内转录间隔区(internal transcribed spacers,ITS)是经常被用作种和种群水平系统研究的分子序列。本文分离了奥利亚罗非鱼(Oreochromis aureus)、尼罗罗非鱼(O.niloticus)内转录间隔区,包括部分18S序列,ITS1、5.8S、ITS2全序列及部分28S序列。4尾奥利亚罗非鱼的10个克隆序列分析表明,其存在长度不同的a、b两种类型ITS1。a型长为536 bp,GC含量为69.96%;b型长为520 bp,GC含量为69.04%～69.42%。4尾尼罗罗非鱼的10个克隆序列分析表明,其只存在a型ITS1,长为536～540 bp,GC含量为69.42%～70.19%。与b型ITS1相比,a型ITS1在16～31 nt有16 bp片段(GGCCCGCCTGCGGCGC)的插入。奥利亚罗非鱼和尼罗罗非鱼共20条ITS序列中,5.8S长度均为157 bp,GC含量为56.69%～57.96%;ITS2为408 bp,GC含量为72.79%～74.26%。奥利亚罗非鱼和尼罗罗非鱼ITS区序列相似性高达98.2%,表明这两种罗非鱼亲缘关系很近。此外,本文对14尾奥利亚罗非鱼、15尾尼罗罗非鱼以及15尾奥尼罗非鱼[O.aureus(♂)×O.niloticus(♀)]ITS1的扩增结果显示,奥利亚罗非鱼均有a、b两种类型ITS1;15尾尼罗罗非鱼中1尾为a、b两类型ITS1,14尾为a型ITS1;15尾奥尼罗非鱼中则有6尾具有a、b两类型ITS1,9尾为单一的a型ITS1。分析表明,奥利亚罗非鱼在ITS1这个位点一致性高,但尼罗罗非鱼中有1尾混杂了奥利亚罗非鱼的基因,同时也说明分子生物学手段应用于种质鉴定比形态学手段更为精确。

分类号： S917.4

  • 相关文献

[1]三种罗非鱼的微卫星分子鉴定和遗传结构分析. 宋红梅,白俊杰,全迎春,李胜杰. 2008

[2]奥利亚罗非鱼、尼罗罗非鱼MyoD1和MyoD2基因特征及差异. 卢中华,俞菊华,李红霞,李建林,唐永凯,阮瑞霞,杨光. 2010

[3]罗非鱼雌、雄群体遗传差异的RAPD分析. 董在杰,农肖颖,黄代中,李丽娟,佟雪红. 2007

[4]微卫星标记分析罗非鱼群体的遗传潜力. 杨弘,李大宇,曹祥,邹芝英,肖炜,祝璟琳. 2011

[5]两个罗非鱼杂交组合亲本群体与杂种F_1的AFLP分析. 周远扬,叶星,卢迈新,黄樟翰,白俊杰,高风英. 2007

[6]奥利亚罗非鱼和尼罗罗非鱼SRY基因同源克隆和序列分析. 杨弘,夏德全,许广平,何杰,曹丽萍,吴婷婷. 2005

[7]18个贵州红托竹荪种质资源的遗传多样性. 卢颖颖,桂阳,龚光禄,魏善元,朱国胜. 2014

[8]天津地区保护地蔬菜根结线虫种类的分子鉴定. 霍建飞,任文来,刘春艳,王勇,田涛,郝永娟,王万立,万久兴. 2012

[9]鲁道夫对盲囊线虫C新种的ITS rDNA序列测定及种系发育关系分析. 张媛,林瑞庆,赵光辉,袁子国,宋慧群,朱兴全. 2009

[10]基于rDNA-ITS和组蛋白3基因序列分析鉴定新疆棉花叶斑病病原. 李映程,张国丽,任毓忠,李海强,武刚,李天义,李国英,张莉. 2018

[11]新月弯孢CLE菌株胞外蛋白对水稻纹枯病的诱导抗性及其菌种鉴定. 王玲,黄世文,唐绍清,朱德峰,王磊. 2008

[12]两株椰心叶甲分离物的鉴定及其系统发育分析. 郭立佳,黄俊生,宋妍,许天委. 2007

[13]甘肃首次发现大豆孢囊线虫(Heteroderaglycines). 彭德良,黄文坤,徐秉良,彭焕. 2015

[14]黑龙江省大豆菌核病菌核盘菌遗传多样性分析. 董利东,王金生,李文滨,吴俊江,范素杰,徐鹏飞,张淑珍. 2015

[15]rDNA ITS序列在果树真菌病害研究中的应用. 索相敏,王献革,李学营,郝婕,鄢新民,冯建忠. 2015

[16]番石榴焦腐病菌LAMP检测方法的建立及应用. 吴敏亮,张溢溪,兰成忠,刘裴清,李本金,陈庆河,翁启勇. 2013

[17]我国不同地区熊蜂短膜虫的感染情况及亲缘关系. 唐裕杰,王刘豪,李凯,李继莲. 2019

[18]白菜类作物ITS序列分析. 高玉梅,张淑江,章时蕃,李菲,王晓武,武剑,孙日飞. 2009

[19]我国耳萝卜螺ITS及5.8SrDNA的克隆及序列分析. 王瑞爱,刘国华,王春仁,张念章,翁亚彪. 2013

[20]内转录间隔区1(ITS-1);用于伊氏锥虫遗传多样性分析的一个争议性标记基因. 田占成,刘光远,谢俊仁,沈辉,张丽艳,张萍,罗金. 2011

作者其他论文 更多>>

微信小程序