甘薯块根响应长喙壳菌(Ceratocystis fimbriata)侵染的转录组测序分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 杨冬静

作者： 杨冬静;马居奎;唐伟;陈晶伟;高方园;张成玲;孙厚俊;谢逸萍

作者机构：

关键词： 甘薯;长喙壳菌;侵染;转录组测序;抗病基因;调控机理

期刊名称： 江西农业学报

ISSN： 1001-8581

年卷期： 2022 年 34 卷 007 期

页码： 60-69

摘要： 以不侵染黑斑病菌长喙壳菌(Ceratocystis fimbriata Ellis et Halsted)的抗病甘薯品种南京92和感病品种徐薯18的薯块为对照组,以侵染时间1、3、7 d时的薯块为处理组进行转录组测序.测序结果表明:在抗病品种中找到36127个差异表达基因(differential expressed genes,DEGs),其中上调、下调表达的基因分别有17387、18740个;在感病品种中找到44663个DEGs,其中上调、下调表达的基因分别有22928、21735个;在相同时间点抗、感品种间的R1 vs S1、R2 vs S2、R3 vs S3和R4 vs S4这4个对比组中有1057个共有DEGs.GO富集分析结果表明:甘薯长喙壳菌侵染3 d时抗、感品种中富集到的前20的GO条目均主要为细胞成分,其次为生物过程和分子调控;隶属于生物过程的单一生物代谢过程、隶属于分子功能的氧化还原酶活性和四吡咯结合,以及隶属于细胞组分的质体和细胞外围等条目在抗、感品种中均被富集到.KEGG通路富集分析结果表明:在富集的前20的KEGG信号通路中,抗、感品种中的差异基因主要被富集到代谢途径、次级代谢产物的生物合成、碳代谢、苯丙烷生物合成、柠檬酸循环/三羧酸循环以及光合作用等通路上.此外,对长喙壳菌侵染甘薯块根的抗性相关基因进行了分析,共鉴定出221个抗性相关基因,其中激酶类(kinase,KIN)基因最多,有117个,占比为52.9%.

分类号： S531.034

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