三个多倍体猕猴桃基因组Survey分析及系统进化研究

文献类型： 中文期刊

第一作者： 周嘉

作者： 周嘉;王飞飞;仲伟敏;齐勇;刘青;史斌斌;张晟;牛歆雨;郑乾明;唐冬梅

作者机构：

关键词： 猕猴桃;基因组survey分析;基因组大小;系统进化

期刊名称： 果树学报

ISSN： 1009-9980

年卷期： 2024 年 41 卷 011 期

页码： 2214-2223

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 【目的】全面了解多倍体猕猴桃种质资源的染色体倍性和基因组特征，并分析其在猕猴桃属植物中的系统进化关系，以期为多倍体猕猴桃全基因组组装提供参考。【方法】基于流式细胞术分析中华猕猴桃AcD2301(Actinidia chinensis)、软枣猕猴桃AcD2302(Actinidia arguta)、对萼猕猴桃AcD2303(Actinidia valvata)染色体倍性，利用Illumina二代测序平台开展基因组Survey分析，并基于SNP构建15种猕猴桃属植物系统进化树。【结果】中华猕猴桃AcD2301、软枣猕猴桃AcD2302、对萼猕猴桃AcD2303的染色体倍性分别为四倍体、四倍体、六倍体，与survey分析结果一致。Kmer分析预测中华猕猴桃AcD2301、软枣猕猴桃AcD2302、对萼猕猴桃AcD2303单套基因组大小分别约为626 Mb、668 Mb、585 Mb，杂合度为3.00%、3.30%、8.06%，重复序列比例为43.70%、45.30%、40.70%。系统进化树显示软枣猕猴桃与对萼猕猴桃亲缘关系较近，且均从中华猕猴桃独立进化而来。【结论】分析了中华猕猴桃AcD2301、软枣猕猴桃AcD2302、对萼猕猴桃AcD2303的染色体倍性、基因组大小和系统进化关系，为将来开展多倍体猕猴桃全基因组测序提供了参考，也为深入研究猕猴桃多倍化和系统进化提供了理论支持。

分类号： S663.4

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