保护品种云茶1号茶树全长转录组测序分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 朱兴正

作者： 朱兴正;夏丽飞;陈林波;田易萍;宋维希;蒋会兵

作者机构：

关键词： 云茶1号;全长转录组;基因分析;功能注释

期刊名称： 茶叶科学

ISSN： 1000-369X

年卷期： 2018 年 02 期

页码： 193-201

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为探讨云茶1号茶树品种优异性状的遗传基础,采用Pac Bio平台进行全长转录组测序,最终获得Polished consensus序列213 389个,预测到CDS有223 120个,检测到195 062个SSR位点。在NR数据库有170 264个同源序列比对到980个物种;有103 124个在KOG数据库得到注释,根据其功能各分为26类;有65 524个得到GO注释分为细胞组分、分子功能及生物学过程等三大类的55个功能组;根据KEGG数据库,105 972个得到了注释,涉及到216个代谢途径分支,包括茶叶品质、活性物质代谢以及抗逆等相关基因等;还预测到隶属于60个转录因子家族的转录因子有5 785个。这些结果为进一步开展云茶1号茶树特异性状基因的标记性引物开发、遗传研究以及品质形成和抗逆机制研究奠定了基础。

分类号： S571.1

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