仿刺参铜锌超氧化物歧化酶基因全长cDNA的克隆及表达分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 高杉
作者: 高杉;董颖;王摆;杨爱馥;陈仲;关晓燕;蒋经伟;姜北;孙红娟;周遵春
作者机构:
关键词: 仿刺参;铜锌超氧化物歧化酶;基因表达;细菌脂多糖刺激
期刊名称: 水产科学
ISSN: 1003-1111
年卷期: 2014 年 33 卷 05 期
页码: 288-295
收录情况: 北大核心
摘要: 采用cDNA末端快速克隆技术首次克隆了仿刺参铜锌超氧化物歧化酶基因的全长cDNA序列,该基因cDNA全长1500bp,其中包含5′-非翻译区长129bp,3′-UTR长912bp,开放阅读框459bp,编码152个氨基酸,预测蛋白分子量为15.47ku。仿刺参铜锌超氧化物歧化酶基因cDNA推导的氨基酸序列具有保守的铜锌超氧化物歧化酶蛋白家族标签序列42 GFHIHQFGDNT52及136GNAGGRAACGVI147,4个Cu2+结合位点(His-44,-46,-61,-118)和4个Zn2+结合位点(His-61,-69,-78,Asp-81),一对二硫键(Cys-55,-144)。氨基酸序列比对结果显示,仿刺参铜锌超氧化物歧化酶与匙胸瘿蜂和烟粉虱相似度最高,为71%。系统进化分析显示仿刺参处于无脊椎动物分支中,与紫海胆位于同一小支上。实时定量PCR结果显示,铜锌超氧化物歧化酶基因mRNA在仿刺参肠、体壁、肌肉、呼吸树、体腔细胞和管足中均有表达,在管足中表达量最高。在细菌脂多糖刺激后4~12h,体腔细胞中铜锌超氧化物歧化酶基因mRNA表达量显著下降,表明仿刺参的铜锌超氧化物歧化酶基因对细菌脂多糖刺激有免疫应答。
分类号: S917.4
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