京星黄鸡IMF系全基因组选择信号检测分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 王永丽
作者: 王永丽;刘晓静;崔焕先;文杰
作者机构:
关键词: 京星黄鸡;选择信号;功能分析;候选基因;肌内脂肪
期刊名称: 中国家禽
ISSN: 1004-6364
年卷期: 2022 年 012 期
页码: 14-20
收录情况: 北大核心
摘要: 为研究京星黄鸡肌内脂肪(Intramuscular fat,IMF)性状的遗传基础,研究选用十六世代IMF选择系(n=252)和对照系(n=264)群体,使用XP-EHH和ΔCLR方法分析两个群体基因组选择信号分布情况,挖掘与京星黄鸡IMF性状相关的基因。结果显示:选择系IMF、甘油三酯(Triglyceride,TG)、活重、屠体重等指标均显著高于对照系;XP-EHH与ΔCLR分别注释到678和1 099个基因,共同筛选到264个候选基因,这些基因与脂代谢、生长发育、神经发育等生物学过程有关,并鉴定到ACSL3、ACSL4、GPX1、IRS4、MAPK8、PLA2G4A、PTGS2、MGLL和PLCB1等9个脂代谢关键候选基因。研究表明,IMF含量的表型选择引起了基因组水平变化,鉴定到9个脂肪代谢关键基因,并发现一些可能与生长和神经发育等相关的基因,为IMF遗传基础研究提供参考。
分类号: S831
- 相关文献
[1]全基因组选择信号解析野牦牛和天祝白牦牛的遗传差异. 鲍麒,梁春年,郭宪,李吉叶,褚敏,阎萍. 2022
[2]不同尾型绵羊全基因组选择信号检测. 刘真,王慧华,刘瑞凿,吴明明,张淑珍,张莉,赵福平,杜立新,魏彩虹. 2015
[3]德南牛全基因组变异解析和功能基因挖掘. 赵家豪,刘贤,张子敬,赵昭,杜蕾,吕世杰,雷初朝,王二耀,黄永震. 2024
[4]基于群体分化指数F_(ST)的绵羊全基因组选择信号检测. 曾滔,赵福平,王光凯,吴明明,魏彩虹,张莉,李利,张红平,杜立新. 2013
[5]动物肌内脂肪沉积相关候选基因的研究进展. 王怡平,徐晨晨,罗海玲. 2017
[6]畜禽肌内脂肪沉积的基因调控及其作用机制. 汪凯歌,闫俊书,宦海琳. 2024
[7]中国环颈雉肌内脂肪相关候选基因的克隆与序列分析. 吴琼,邢秀梅,荣敏,杨福合. 2009
[8]鸡肉质风味性状相关候选基因的研究进展. 束婧婷,包文斌,张学余,陈国宏. 2006
[9]猪H-FABP基因第2内含子SNPs分布及连锁不平衡遗传模式研究. 王立刚,张龙超,赵克斌,颜华,王立贤. 2011
[10]大豆铝激活苹果酸转运家族基因GmALMT8的鉴定与功能验证. 刘慧,许文静,张红梅,刘晓庆,张威,王琼,朱月林,陈华涛. 2024
[11]基于RAD-seq简化基因组测序的19个地方鸡种遗传进化研究. 韩威,朱云芬,殷建玫,李国辉,薛倩,张会永,沈海玉,苏一军,窦新红,王克华,邹剑敏. 2020
[12]基于RAD-seq技术分析边鸡保种群体的遗传进化. 李国辉,魏清宇,张会永,殷建玫,薛倩,朱云芬,苏一军,王克华,邹剑敏,韩威. 2019
[13]德国肉用美利奴羊全基因组选择信号检测. 刘佳森,李蕴华,王润元,蒋守军,马万山,王利勇. 2019
[14]肃南牦牛群体遗传结构、选择信号分析和ROH检测. 鲍麒,包鹏甲,马晓明,吴晓云,孟光耀,褚敏,曹红梅,郎建英,安玉峰,梁春年,阎萍. 2022
[15]太湖鹅4个群体保种效果的遗传评价. 刘宏祥,王健,宋卫涛,朱春红,陶志云,徐文娟,章双杰,李慧芳. 2021
[16]基于简化基因组测序的天津猴鸡遗传进化研究. 夏树立,周成浩,赵向华,于海涛,张会永,殷建玫,薛倩,韩威,李国辉. 2022
[17]基于RAD-Seq简化基因组测序分析琅琊鸡的遗传进化. 殷建玫,朱云芬,李国辉,张会永,薛倩,周成浩,蒋一秀,苏一军,韩威. 2023
[18]西藏山羊高海拔适应性的选择信号筛选. 金美林,陆健,费晓娟,卢曾奎,权凯,储明星,狄冉,王慧华,魏彩虹. 2020
[19]基于温带和热带玉米群体全基因组F_(ST)和XP-EHH的选择信号检测. 杨宇昕,邹枨. 2019
[20]全基因组选择信号检测方法在家畜研究中的应用进展. 阿地力江·卡德尔,刘雪雪,杨敏,玛哈巴·肉孜,蒋琳,马月辉. 2016
作者其他论文 更多>>
-
岩藻多糖调控肠道黏膜屏障功能及其在动物生产中的应用
作者:韩丰韦;王哲奇;刘晓静;红雷;史彬林;徐元庆
关键词:岩藻多糖;肠道黏膜屏障;黏膜免疫;肠道菌群结构
-
基于全基因组关联分析揭示肉鸡腿病发生的遗传机制
作者:唐鑫鑫;郑炬梅;骆娜;营凡;朱丹;李森;刘大伟;安炳星;文杰;赵桂苹;李和刚
关键词:白羽肉鸡;腿病;全基因组关联分析;候选基因
-
肠道微生物对家禽抗病力的影响研究进展
作者:李想;王巧;李庆贺;文杰;赵桂苹
关键词:家禽;肠道微生物;抗病
-
2023年我国肉鸡产业形势分析、未来展望与对策建议
作者:辛翔飞;郑麦青;文杰;王济民
关键词:肉鸡;产业;形势;趋势;对策建议
-
肉鸡屠宰性状全基因组关联分析
作者:王一东;陈智武;黄超;粟永春;余洋;崔焕先;郑麦青;赵桂苹;文杰;王述柏
关键词:肉鸡;屠宰性状;全基因组关联分析;单核苷酸多态性
-
用关爱和包容建设儿童青少年的心理安全网——新加坡儿童青少年心理健康服务研究
作者:刘伊宁;刘瑞琪;邢淑芬;王永丽
关键词:新加坡;儿童青少年;心理健康服务;REACH模式;信息化手段
-
肉鸡半净膛率和全净膛率相关SNPs鉴定
作者:门立林;王一东;杜永旺;崔焕先;郑麦青;陈智武
关键词:半净膛率;全净膛率;全基因组关联分析;遗传变异;肉鸡