京星黄鸡IMF系全基因组选择信号检测分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 王永丽
作者: 王永丽;刘晓静;崔焕先;文杰
作者机构:
关键词: 京星黄鸡;选择信号;功能分析;候选基因;肌内脂肪
期刊名称: 中国家禽
ISSN: 1004-6364
年卷期: 2022 年 012 期
页码: 14-20
收录情况: 北大核心
摘要: 为研究京星黄鸡肌内脂肪(Intramuscular fat,IMF)性状的遗传基础,研究选用十六世代IMF选择系(n=252)和对照系(n=264)群体,使用XP-EHH和ΔCLR方法分析两个群体基因组选择信号分布情况,挖掘与京星黄鸡IMF性状相关的基因。结果显示:选择系IMF、甘油三酯(Triglyceride,TG)、活重、屠体重等指标均显著高于对照系;XP-EHH与ΔCLR分别注释到678和1 099个基因,共同筛选到264个候选基因,这些基因与脂代谢、生长发育、神经发育等生物学过程有关,并鉴定到ACSL3、ACSL4、GPX1、IRS4、MAPK8、PLA2G4A、PTGS2、MGLL和PLCB1等9个脂代谢关键候选基因。研究表明,IMF含量的表型选择引起了基因组水平变化,鉴定到9个脂肪代谢关键基因,并发现一些可能与生长和神经发育等相关的基因,为IMF遗传基础研究提供参考。
分类号: S831
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