京星黄鸡IMF系全基因组选择信号检测分析

文献类型: 中文期刊

第一作者: 王永丽

作者: 王永丽;刘晓静;崔焕先;文杰

作者机构:

关键词: 京星黄鸡;选择信号;功能分析;候选基因;肌内脂肪

期刊名称: 中国家禽

ISSN: 1004-6364

年卷期: 2022 年 012 期

页码: 14-20

收录情况: 北大核心

摘要: 为研究京星黄鸡肌内脂肪(Intramuscular fat,IMF)性状的遗传基础,研究选用十六世代IMF选择系(n=252)和对照系(n=264)群体,使用XP-EHH和ΔCLR方法分析两个群体基因组选择信号分布情况,挖掘与京星黄鸡IMF性状相关的基因。结果显示:选择系IMF、甘油三酯(Triglyceride,TG)、活重、屠体重等指标均显著高于对照系;XP-EHH与ΔCLR分别注释到678和1 099个基因,共同筛选到264个候选基因,这些基因与脂代谢、生长发育、神经发育等生物学过程有关,并鉴定到ACSL3、ACSL4、GPX1、IRS4、MAPK8、PLA2G4A、PTGS2、MGLL和PLCB1等9个脂代谢关键候选基因。研究表明,IMF含量的表型选择引起了基因组水平变化,鉴定到9个脂肪代谢关键基因,并发现一些可能与生长和神经发育等相关的基因,为IMF遗传基础研究提供参考。

分类号: S831

  • 相关文献

[1]全基因组选择信号解析野牦牛和天祝白牦牛的遗传差异. 鲍麒,梁春年,郭宪,李吉叶,褚敏,阎萍. 2022

[2]不同尾型绵羊全基因组选择信号检测. 刘真,王慧华,刘瑞凿,吴明明,张淑珍,张莉,赵福平,杜立新,魏彩虹. 2015

[3]德南牛全基因组变异解析和功能基因挖掘. 赵家豪,刘贤,张子敬,赵昭,杜蕾,吕世杰,雷初朝,王二耀,黄永震. 2024

[4]基于群体分化指数F_(ST)的绵羊全基因组选择信号检测. 曾滔,赵福平,王光凯,吴明明,魏彩虹,张莉,李利,张红平,杜立新. 2013

[5]川乡黑猪基因组选择信号分析. 梁艳,顾以韧,刘鹏亮,郝晓东,弥世荣,陶璇,杨雪梅,杨跃奎,王言,陈晓晖,龚建军,吕学斌,何志平. 2024

[6]全基因组选择信号筛选和田羊异质被毛相关候选基因. 张彦威,徐新明,于丽娟,田月珍,谢梦婉,唐丽苹,郑培宇,宋楠楠,狄江. 2025

[7]“太行云牛”群体遗传结构与基因组选择信号分析. 王 坤,张 元庆,陈 卓,刘 彦杰,王 泽昭,李 博,程 景,牛 晓艳. 2025

[8]"太行云牛"群体遗传结构与基因组选择信号分析. 王坤,张元庆,陈卓,刘彦杰,王泽昭,李博,程景,牛晓艳. 2025

[9]金定鸭与台湾褐色菜鸭遗传差异全基因组选择信号分析. 朱志明,李辉煌,王均辉,赵邦哲,施文莉,蔡倩楠,刘长涛,李丽,辛清武,缪中纬,章琳俐,刘晓盼,黄种彬,郑嫩珠. 2025

[10]动物肌内脂肪沉积相关候选基因的研究进展. 王怡平,徐晨晨,罗海玲. 2017

[11]畜禽肌内脂肪沉积的基因调控及其作用机制. 汪凯歌,闫俊书,宦海琳. 2024

[12]中国环颈雉肌内脂肪相关候选基因的克隆与序列分析. 吴琼,邢秀梅,荣敏,杨福合. 2009

[13]鸡肉质风味性状相关候选基因的研究进展. 束婧婷,包文斌,张学余,陈国宏. 2006

[14]猪H-FABP基因第2内含子SNPs分布及连锁不平衡遗传模式研究. 王立刚,张龙超,赵克斌,颜华,王立贤. 2011

[15]大豆铝激活苹果酸转运家族基因GmALMT8的鉴定与功能验证. 刘慧,许文静,张红梅,刘晓庆,张威,王琼,朱月林,陈华涛. 2024

[16]基于RAD-seq简化基因组测序的19个地方鸡种遗传进化研究. 韩威,朱云芬,殷建玫,李国辉,薛倩,张会永,沈海玉,苏一军,窦新红,王克华,邹剑敏. 2020

[17]基于RAD-seq技术分析边鸡保种群体的遗传进化. 李国辉,魏清宇,张会永,殷建玫,薛倩,朱云芬,苏一军,王克华,邹剑敏,韩威. 2019

[18]德国肉用美利奴羊全基因组选择信号检测. 刘佳森,李蕴华,王润元,蒋守军,马万山,王利勇. 2019

[19]肃南牦牛群体遗传结构、选择信号分析和ROH检测. 鲍麒,包鹏甲,马晓明,吴晓云,孟光耀,褚敏,曹红梅,郎建英,安玉峰,梁春年,阎萍. 2022

[20]太湖鹅4个群体保种效果的遗传评价. 刘宏祥,王健,宋卫涛,朱春红,陶志云,徐文娟,章双杰,李慧芳. 2021

作者其他论文 更多>>