湖北株H3N8亚型马流感病毒HA基因的序列测定及其HA蛋白遗传特性分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 黄文强

作者： 黄文强;郭巍;赵立平;盛名巍;王宇;李红梅;相文华

作者机构：

关键词： H3N8亚型马流感病毒;HA基因;马流感疫苗

期刊名称： 中国兽医学报

ISSN： 1005-4545

年卷期： 2010 年 30 卷 05 期

页码： 612-614+656

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 2008年从湖北省分离到1株H3N8亚型马流感病毒A/equine/Hubei/6/08。以2002年美国KENTUKY株为模板设计HA基因测序引物,进行RT-PCR,然后测定该分离株的HA基因核苷酸序列。经NCBI上Blast同源性比较发现,与A/equine/Newmarket/5/2003(H3N8)同源性较高为98.7%。HA蛋白遗传进化分析表明该毒株隶属于H3N8亚型马流感病毒中的美洲系福罗里达亚系。该株与OIE现在推荐的疫苗候选株A/equine/Kentuck-y/5/2002(H3N8)HA1蛋白氨基酸序列比对发现有3处氨基酸替换位点;与OIE以往推荐的疫苗候选株A/e-quine/Kentucky/1/1994(H3N8)比对发现有11处氨基酸替换位点。研究结果表明该分离株可作为中国研制马流感疫苗的候选株。

分类号： S852.652

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