基于线粒体D-loop区与COI基因序列比较分析养殖与野生银鲳群体遗传多样性

文献类型： 中文期刊

第一作者： 彭士明

作者： 彭士明;施兆鸿;侯俊利

作者机构：

关键词： 银鲳;线粒体DNA;养殖;野生;遗传多样性

期刊名称： 水产学报

ISSN： 1000-0615

年卷期： 2010 年 34 卷 01 期

页码： 19-25

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 运用线粒体D-loop区与COI基因片段序列比较分析了养殖与野生银鲳群体的遗传多样性。研究结果显示,线粒体D-loop区片段中,A、T、C与G4种核苷酸的平均含量分别为40.00%、30.55%、16.75%和12.70%,A+T的含量为70.55%,明显高于G+C的含量。COI基因片段中,A、T、C和G的平均含量分别为25.85%、33.90%、21.30%和18.85%,A+T的含量(59.75%)同样高于G+C的含量。基于D-loop序列分析所得出的两群体总的变异位点、单倍型数、单倍型多样性、核苷酸多样性及平均核苷酸差异数分别为19、15、0.895、0.007和2.505。基于COI基因所得出的两群体总的变异位点、单倍型数、单倍型多样性、核苷酸多样性及平均核苷酸差异数分别为33、17、0.713、0.004和2.239。基于线粒体D-loop区与COI基因片段序列的研究结果均显示,养殖银鲳群体的遗传多样性低于野生群体的遗传多样性。养殖群体基于线粒体D-loop区与COI基因片段分析得出的单倍型多样性分别为0.562与0.571,野生群体基于线粒体D-loop区与COI基因片段分析得出的单倍型多样性分别为0.891与0.801。基于D-loop序列的分子方差(AMOVA)分析结果显示,养殖与野生银鲳群体间具有较高的遗传分化,而基于COI基因片段AMOVA分析结果显示,两群体间并无明显的遗传分化。研究表明,线粒体D-loop区与COI基因均可作为检测银鲳群体遗传多样性的有效标记,但线粒体D-loop区作为反映银鲳群体间遗传多样的敏感度要高于COI基因。

分类号： S917.4

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