向日葵盐诱导HD-Zip类转录因子HB-12的克隆及表达分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 孙瑞芬

作者： 孙瑞芬;张艳芳;郭树春;于海峰;李素萍;聂惠;安玉麟

作者机构：

关键词： 向日葵;HB-12;HD-Zip;胁迫;表达分析

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2017 年 06 期

页码： 2077-2087

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： HB转录因子家族基因在植物生长、发育、生物和非生物胁迫中发挥着重要作用。根据已知序列Unigene551_All设计引物,利用SMARTer RACE技术从向日葵中克隆了一个HD-Zip类转录因子HB-12,该基因全长cDNA序列821 bp,包括长度为573 bp的开放阅读框,编码190个氨基酸。预测该蛋白的分子量和等电点分别为22.55 kD和5.58,具有一个同源异型框结构域(homeobox domain,HD)和一个同源异型框结合类亮氨酸拉链结构域(homeobox associated leucine zipper domain,HALZ),属于向日葵HD-ZipⅠ类蛋白,基因登录号为KU315052。HB-12蛋白不存在跨膜域,亚细胞定位预测其可能位于细胞核。聚类分析发现向日葵HB-12与茄科作物马铃薯和番茄HB-12基因亲缘关系较近。利用PCR技术扩增了HB-12全长cDNA对应的g DNA序列,该序列自起始密码子ATG至终止密码子TAA长度为652 bp,由2个外显子和1个内含子组成,基因登录号为KU315053。Real-time PCR结果表明,HB-12在向日葵根、下胚轴和叶中的表达存在器官特异性,且受盐、ABA及PEG的诱导表达。HB-12基因的克隆及表达分析为向日葵抗逆分子育种和功能研究奠定了基础。

分类号： Q943.2`S565.5

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