草莓果实不同发育阶段抑制差减文库(SSH)的构建及相关基因的表达分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 周厚成

作者： 周厚成;李刚;赵霞;王子成;郭蔼光

作者机构：

关键词： 草莓;果实;抑制差减杂交(SSH);基因表达;qRT-PCR

期刊名称： 农业生物技术学报

ISSN： 1674-7968

年卷期： 2013 年 21 卷 06 期

页码： 641-649

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 寻找控制草莓果实硬度、成熟软化和褐化等性状相关基因并进行有效的调控具有现实意义,本研究分别以丰香草莓(Fragaria×ananassa Duch.cv.Toyonoka)果实大绿果期和转色期两个发育阶段的cDNA为实验组(tester)和驱动组(driver),利用抑制差减杂交(suppression subtraction hybridization,SSH)技术构建了正反两个cDNA文库,分别包含516和524个克隆。通过EST测序、序列拼接后,共获得707条uniESTs,其中正反向文库分别为369和338个非冗余序列(uniESTs),包括123条拼接序列(contigs)和584条单一序列(singletons)。在Nt库比对中有537条uinESTs与已知基因匹配,占比75.95%;在Nr库比对中有509条序列有匹配蛋白,占比71.99%。有193个uniESTs能进行Geney ontology(GO)功能注释,其中细胞组分被注释了315次、分子功能被注释了332次、生物过程被注释了409次。uniESTs的功能分析显示,绿果期文库多数与细胞营养生长、分裂、早期胚胎发育和营养运输有关,转色期文库主要与刺激代谢物形成、色素合成、果实软化和种子成熟有关,与草莓果实发育和成熟生理过程基本一致。采用qRT-PCR对果实成熟相关蛋白(putative ripening-related protein)、多聚半乳糖醛酸酶(polygalacturonase,PG)、MYB转录因子(MYB transcription factor,MYB)、类异黄酮还原酶(isoflavone reductase-like gene,IRL)、胚胎发育晚期丰富蛋白(later embryo abundant protein,LEA)、乙烯受体Etr1(ethylene receptor Etr1)等6个基因在草莓果实发育、成熟期在根、叶、花中的表达模式进行了分析,研究结果为进一步研究草莓果实发育和成熟机制提供基础资料。

分类号： S668.4

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