高通量测序技术研究棉蚜携带病毒种类

文献类型： 中文期刊

第一作者： 吕丽敏

作者： 吕丽敏;王春义;雒珺瑜;李春花;崔金杰

作者机构：

关键词： 棉蚜;病毒;高通量测序;基因组;转录组

期刊名称： 棉花学报

ISSN： 1002-7807

年卷期： 2014 年 26 卷 06 期

页码： 539-545

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 棉蚜是传播寄主植物病毒的主要昆虫媒介,但对棉蚜携带的病毒种类及病毒基因组序列信息了解较少。本文利用高通量测序技术,对棉蚜田间自然种群所携带的病毒基因序列进行发掘、鉴定和分类。通过对田间苗蚜和伏蚜转录组数据进行分析,获得18种病毒基因组序列,其中17种病毒为未报道过基因组信息的种类。在18种病毒中,有13种为正链RNA病毒。苗蚜携带病毒的种类和数量都远远高于伏蚜,苗蚜携带全部的18种病毒;伏蚜仅携带8种,而且携带病毒的FPKM(Fragments per kb per million fragments)值较低。本研究丰富了棉蚜所携带的病毒基因组信息,为棉蚜传毒机制研究打下基础。

分类号： S435.62

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