高粱Dof基因家族鉴定及表达分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 付森杰

作者： 付森杰;宋迎辉;朱灿灿;叶珍言;秦娜;代书桃;刘海霞;王春义;李君霞

作者机构：

关键词： 高粱;Dof基因家族;转录因子;全基因组鉴定;PEG处理

期刊名称： 作物杂志

ISSN： 1001-7283

年卷期： 2025 年 001 期

页码： 54-65

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： DNA结合单锌指蛋白（DNA binding with one finger,Dof）是植物中特有的一类转录因子，参与调控植物组织分化、种子萌发、植物抗逆及代谢等生理生化过程。为鉴定并分析高粱Dof转录因子家族成员，利用生物信息学方法从全基因组水平对高粱Dof转录因子家族成员的基本基因结构、理化性质、保守基序、启动子顺式作用元件、组织特异性表达及干旱胁迫表达等进行分析。20%PEG6000模拟干旱胁迫处理豫粱10号的幼苗后，利用qPCR技术分析Dof基因家族成员响应不同时间段干旱胁迫的表达情况。结果共鉴定了30个高粱Dof基因，分布在9条染色体上，基因保守性分析结果显示，Motif1（即锌指结构）是高粱Dof基因家族中保守的蛋白质序列；其中29个基因中都含有CX2CX21CX2C保守基序，而SbDof15基因保守序列为CX20CX2C；启动子结构分析表明，Dof基因的启动子区域中含有ABA、MYB、MeJA、低温等逆境胁迫响应元件；进化树分析结果表明，高粱Dof蛋白与玉米的同源性更高，热图分析表明Dof家族成员在高粱的不同部位都有表达。qRT-PCR结果表明，高粱Dof基因家族成员可能参与高粱应对干旱胁迫的响应，不同的Dof基因成员在应对干旱胁迫时的调控机制可能不一样。

分类号： S514

  • 相关文献

[1]高粱组ⅢWRKY转录因子对干旱胁迫的表达分析. 徐磊,刘洋. 2021

[2]高粱耐冷基因全基因组鉴定及进化分析. 张国琴,葛玉彬,张正英. 2020

[3]高粱GATA基因家族的全基因组鉴定及表达分析. 宋迎辉,朱灿灿,代书桃,秦娜,王春义,张真,李君霞,平西栓. 2022

[4]高粱CIPK家族基因的全基因组鉴定及非生物胁迫下的表达特征. 徐鹏,李春宏,范昕琦,梁笃,沈新莲. 2024

[5]高粱LBD基因家族的鉴定及苗期干旱胁迫表达分析. 宋迎辉,付森杰,朱灿灿,代书桃,秦娜,景雅,张真,薛淑霞,李君霞. 2024

[6]高粱缺氮特异诱导基因SbMYB-like克隆及功能分析. 朱振兴,李丹,陆晓春. 2023

[7]高粱GATA转录因子家族的鉴定和表达模式分析. 姚茂星,周光怡,丁延庆,李魁印,任明见. 2022

[8]PEG处理下小麦种子萌发期的性状变化与品种抗旱性级别划分. 周国雁,隆文杰,雷涌涛,蔡青,伍少云. 2015

[9]水稻Dof基因家族的组织表达谱及胁迫诱导表达特征分析. 周淑芬,颜静宛,刘华清,林智敏,陈睿,杨绍华,王锋. 2012

[10]8个玉米DOF家族基因对非生物胁迫的响应模式分析. 贾利强,赵秋芳,陈曙. 2021

[11]小麦几丁质酶基因家族的全基因组鉴定及禾谷镰刀菌胁迫下的表达分析. 徐武,刘建丰,张戈,徐文,袁祖丽. 2019

[12]辣椒BES1基因家族鉴定及表达分析. 孟纯阳,魏小春,赵艳艳,原玉香,王志勇,杨双娟,姜俊,张晓伟. 2019

[13]菜用大豆液泡膜内在蛋白(TIPs)基因鉴定及表达分析. 冯志娟,徐盛春,刘娜,张古文,胡齐赞,龚亚明. 2018

[14]大豆分枝相关CYC/TB1-Like(CYL)基因鉴定及菜用大豆品种的激素表达谱分析. 冯志娟,刘娜,张古文,徐盛春,龚亚明. 2019

[15]葡萄CHX基因家族全基因组鉴定及生物信息学分析. 杜宜洋,连红娟,李晓梅,谭敏,杨镕兆,刘政海,杨兆亮,唐晓萍,董志刚,李捷. 2020

[16]大豆NIP类水孔蛋白基因的鉴定及表达特性分析. 吴伟,冯志娟,徐盛春,刘娜,张古文,胡齐赞,龚亚明. 2018

[17]玉米GATA基因家族的全基因组鉴定及热胁迫下的表达分析. 王延召,周波,韩小花,黄保,鲁晓民,程军玲,王淑凤,聂利红. 2020

[18]梨CDPK基因家族全基因组序列鉴定分析. 许园园,李晓刚,李慧,蔺经,常有宏. 2015

[19]菠萝SPL基因家族全基因组鉴定及其在开花诱导中的表达分析. 潘晓璐,张秀梅,许婷婷,侯世贵,张红娜. 2020

[20]谷子GRAS转录因子家族的全基因组鉴定、表达分析及标记开发. 王智兰,韩康妮,杜晓芬,李禹欣,连世超,王军. 2022

作者其他论文 更多>>

微信小程序