盐胁迫下谷子叶片转录组de novo测序及分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 牛银亭

作者： 牛银亭;鞠乐;阴志刚;刘瑞;曹双;陈培育;李君霞

作者机构：

关键词： 转录组;谷子;耐盐基因;挖掘;盐胁迫;差异表达基因(DEG)

期刊名称： 江苏农业科学

ISSN： 1002-1302

年卷期： 2025 年 53 卷 014 期

页码： 55-62

收录情况： 北大核心

摘要： 为挖掘出与耐盐相关的基因，解析谷子耐盐机制和指导谷子耐盐育种提供理论支撑，本研究以宛谷098为试验材料，对盐胁迫前后谷子苗期倒二叶叶片进行转录组de novo测序，并采用实时荧光定量RT-PCR进行功能基因验证。结果表明，本研究通过de novo转录组测序检测到宛谷098盐胁迫前后倒二叶中1 793个差异表达基因(其中上调基因1 054个，下调基因739个),主要为细胞质翻译、细胞质核糖体、核糖体亚基、核糖体的结构成分、依赖信号识别颗粒(SRP)的共翻译蛋白靶向膜等基因。根据GO注释分析发现，参与生物过程的基因差异表达最多，其次是细胞组分，而参与分子功能的基因较少；差异基因数量最高的5个GO项是细胞质翻译和依赖SRP的共翻译蛋白靶向膜2个生物过程、细胞质核糖体和核糖体亚基2个细胞组分、核糖体的结构成分1个分子功能。KEGG代谢途径富集分析结果表明，DEG主要富集在苯丙氨酸代谢、细胞色素P450对异种生物的代谢、药物代谢-细胞色素P450、氨基酸和核苷酸糖代谢、谷胱甘肽代谢等代谢途径和苯丙氨酸的生物合成、类黄酮的生物合成、类胡萝卜素的生物合成等生物学合成上。谷胱甘肽转移酶主要参与细胞色素P450对异种生物的代谢通路、药物代谢-细胞色素P450通路、谷胱甘肽代谢通路、药物代谢-其他酶等通路，参与了活性氧清除过程；核糖体蛋白基因家族是调控植物抗逆性的宝贵资源，在植物耐盐性方面发挥着重要作用。本研究表明，谷子盐胁迫前后基因表达差异显著。

分类号： S515

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