鸡传染性支气管炎病毒ck/CH/LHLJ/090908株的基因组特性研究

文献类型: 中文期刊

第一作者: 陈玲凤

作者: 陈玲凤;韩宗玺;邵昱昊;孔宪刚;刘胜旺

作者机构:

关键词: 鸡传染性支气管炎病毒;基因组序列;序列分析;点突变;缺失

期刊名称: 中国预防兽医学报

ISSN: 1008-0589

年卷期: 2014 年 11 期

页码: 838-841

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 为了解传染性支气管炎病毒(IBV)H120疫苗病毒株的变异情况,本研究利用设计的16对引物扩增分离株ck/CH/LHLJ/090908的基因组序列,并采用3'-RACE和5'-RACE技术,扩增得到该病毒全基因组序列。通过与已发表参考病毒株的全基因组序列进行比较分析,结果表明该分离株基因组全长为27 609 nt,其基因排序未发生改变,纤突蛋白裂解位点为533RRFRR537。遗传进化分析表明该分离株与H120疫苗株的基因组具有高度同源性(99.7%),进化亲缘关系最近。对其基因组序列进行进一步的分析表明,该分离株的E基因发生了248 nt~280 nt连续33个核苷酸的缺失,导致其编码的E蛋白缺失11个氨基酸,推测该分离株为H120疫苗株在鸡群中自然传代进化的变异株。

分类号: S852.65

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