马铃薯StPGIP基因克隆、生物信息学特征及差异表达分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 吴玉

作者： 吴玉;彭杰椿;郑声皓;易若兰;范斗文;黄雅;萧燕梅;韦荣昌;郑虚;邓英毅

作者机构：

关键词： 马铃薯;StPGIP;基因克隆;生物信息学特征;差异表达;休眠

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2025 年 23 卷 002 期

页码： 362-370

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 以‘桂农薯1号’马铃薯块茎为试材，克隆马铃薯多聚半乳糖醛酸酶抑制蛋白基因StPGIP的CDS序列，并研究其生物信息学特征和块茎休眠与发芽过程中的特异性表达。结果表明StPGIP基因的CDS全长为1 005 bp，编码335个氨基酸，是位于线粒体或细胞核分泌途径的信号肽蛋白，剪切位点位于第25和26氨基酸之间；其蛋白质二级结构中含有无规卷曲(57.49%)、α-螺旋(24.55%)、β-折叠(2.40%)和延伸链(15.57%)，三级结构是由α-螺旋和β-折叠形成的一个保守的马蹄形结构；启动子序列中存在光、水杨酸、脱落酸等响应元件。StPGIP基因与野生无薯系马铃薯(Solanum brevidens Fill)、辣椒(Capsicum annuum L.)、野生潘那利番茄(Solanum pennellii Correll)进化关系较近。RT-qPCR分析表明块茎StPGIP基因表达量在低温贮藏的休眠期内呈下降趋势，萌芽后极显著上升，马铃薯StPGIP基因对马铃薯休眠与发芽有重要影响。研究结果为今后深入挖掘该基因的功能及调控提供了理论依据。

分类号： S532

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