茶树叶片ESTs序列及其功能基因表达谱特征分析

文献类型: 中文期刊

第一作者: 赵丽萍

作者: 赵丽萍;陈亮;高其康

作者机构:

关键词: ESTs;茶树叶片;基因表达谱;代谢相关基因;表达序列标签;蛋白质数据库;蛋白质合成;比对结果;细胞结构;无色花色素

期刊名称: 中国茶叶学会成立四十周年庆祝大会暨2004年学术年会论文集

ISSN:

年卷期: 2004 年

页码: 6

收录情况: CSCD

摘要: 在建立龙井43春季叶片cDNA文库后,进行了高通量的cDNA克隆测序,共获1684个高质量的表达序列标签(ESTs),并与NCBI的非冗余核酸与蛋白质数据库进行BlastN、BlastX比对,分别表明607个和1008个ESTs为已知功能或具推测功能基因,占总数的63.8%和28.7%。为了对茶树叶片基因表达谱有更加深入的了解,按照拟南芥功能基因分类标准,把BlastX比对结果中具有已知功能或推测功能的1008个ESTs,根据所参与的细胞过程将其分为12大类,即代谢相关基因占8.3%、能量相关基因占26.4%、细胞生长与分化基因占3.8%、转录相关基因占3.9%、蛋白质合成相关基因占17.9%...

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