6种血清型鸭疫里默氏菌SSPA基因的克隆及序列分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 陈红梅

作者： 陈红梅;程龙飞;傅光华;施少华;万春和;傅秋玲;张丹青;黄瑜

作者机构：

关键词： 鸭;疫里默氏菌;SSPA基因;克隆;序列分析

期刊名称： 福建农业学报

ISSN： 1008-0384

年卷期： 2015 年 09 期

页码： 831-835

摘要： 为了解鸭疫里默氏菌SSPA基因的生物学信息,参照GenBank登录的鸭疫里默氏菌SSPA基因序列设计了1对特异性引物,成功克隆6种血清型鸭疫里默氏菌SSPA基因,并利用生物信息学软件DNAstar及在线分析工具SignalP V4.0、TM-HMM Server V.2.0、NetNGly c1.0、YinOYang 1.0和NetPhos 2.0对推导的氨基酸序列进行分析。结果显示:该基因的ORF全长1 692bp,可编码563个氨基酸;氨基酸序列含有1个潜在的N-糖基化位点,1个潜在的O-糖基化位点,以及38个潜在的磷酸化位点(包括12个丝氨酸、9个苏氨酸和17个酪氨酸位点),无跨膜区;该蛋白信号肽切割部位位于第19位的A(丙氨酸)和第20位的Q(谷氨酰胺)之间;6种血清型鸭疫里默氏菌SSPA基因的核苷酸同源性为95.7%~100.0%,氨基酸同源性为98.2%~100.0%。

分类号： S852.61

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