贵州黑山羊ADD1基因克隆、生物信息学及组织表达规律研究

文献类型： 中文期刊

第一作者： 杨洋

作者： 杨洋;袁超;龙勇;肖文

作者机构：

关键词： 贵州黑山羊;ADD1基因;生物信息学分析;组织表达;背最长肌;腿肌;时序表达

期刊名称： 黑龙江畜牧兽医

ISSN： 1004-7034

年卷期： 2024 年 002 期

页码： 43-49,59

收录情况： 北大核心

摘要： 为了分析贵州黑山羊ADD1 基因编码区序列(coding sequence,CDS)信息及在组织中的表达规律,试验克隆了贵州黑山羊ADD1 基因CDS并进行了生物信息学分析,同时分析了该基因在 12 月龄贵州黑山羊心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏、皮下脂肪、背最长肌和腿肌组织中的表达规律,以及在 1,3,6,9,12 月龄贵州黑山羊皮下脂肪、背最长肌和腿肌组织中的表达时序情况.结果表明:贵州黑山羊ADD1 基因CDS大小为2 304 bp,编码767 个氨基酸,与山羊ADD1基因序列相似性较高,与禽类的相似性较低;ADD1 蛋白中的主要氨基酸为丝氨酸(Ser)、脯氨酸(Pro)、谷氨酸(Glu)和亮氨酸(Leu),含量分别为 9.0%、8.7%、8.5%、8.2%,分子质量为 84.05 ku,分子式为C3682 H5840 N1036 S24,理论等电点为 5.74,为不稳定蛋白和亲水蛋白,主要定位在细胞核中,与ADD蛋白家族(ADD2 和ADD3)、加帽蛋白(capping actin protein,CAPG)、肌侵蛋白(myotrophin,MTPN)、X盒结合蛋白 1(X-box binding protein 1,XBP1)、固醇调节元件结合蛋白 1(sterol-regulatory element-binding protein 1,SREBP1)等蛋白存在相互作用,二级结构和三级结构中主要含有α螺旋和无规则卷曲;ADD1 基因在 12 月龄贵州黑山羊心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏、皮下脂肪、背最长肌和腿肌组织中均有表达,皮下脂肪中的表达量最高,极显著高于其他组织(P<0.01),其次在心脏、背最长肌、肝脏和腿肌中表达量较高,在脾脏中表达量最低.ADD1 基因在 1,3 月龄贵州黑山羊脂肪、背最长肌和腿肌组织中的表达量均较低.在脂肪组织中 6 月龄时最高,极显著高于其他月龄(P<0.01);3 月龄时最低,极显著低于其他月龄(P<0.01).在背最长肌中9,12 月龄较高,二者差异不显著(P>0.05),但均极显著高于其他月龄(P<0.01);6 月龄表达量最低,与 1 月龄差异不显著(P>0.05),但二者均极显著低于其他月龄(P<0.01).在腿肌中 9 月龄时最高,极显著高于其他月龄(P<0.01);12 月龄最低,与 1 月龄差异不显著(P>0.05),但二者均极显著低于其他月龄(P<0.01).说明ADD1 基因在贵州黑山羊各组织中的表达具有广谱性和差异性.

分类号： S826.2

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