利用荧光SSR分析中国糜子的遗传多样性和群体遗传结构

文献类型： 中文期刊

第一作者： 寇淑君

作者： 寇淑君;霍阿红;付国庆;纪军建;王瑶;左振兴;刘敏轩;陆平

作者机构：

关键词： 糜子;SSR荧光标记;遗传多样性;群体结构

期刊名称： 中国农业科学

ISSN： 0578-1752

年卷期： 2019 年 9 期

页码： 1475-1487

摘要： [目的]利用荧光SSR研究中国糜子的遗传多样性与群体遗传结构,为糜子品种改良、种质创新和资源利用提供依据.[方法]用不同地理来源且表型差异较大的6份糜子材料对SSR引物进行筛选,通过变性聚丙烯酰胺凝胶电泳获得条带清晰、稳定性好、多态性高的糜子SSR引物,对筛选出的引物5′末端进行6-FAM、HEX、ROX和TAMRA荧光标记,利用基因分析仪检测不同等位变异的扩增片段大小,并以此来分析131份糜子材料的遗传多样性和群体结构.[结果]从202对SSR引物中共筛选出22对扩增稳定、多态性好的SSR引物,能同时适用于传统变性PAGE胶电泳和荧光SSR标记-全自动分析检测技术.22对SSR引物共检测出128个主要等位变异,平均每个位点5.82个;基因多样性指数变化范围为0.3572-0.8132,平均0.6284;多态性信息含量为0.2934-0.8150,平均0.5874;Shannon多样性指数为0.5427-1.7681,平均1.2062.不同生态区糜子种质间遗传距离的变化范围为0.0764-0.7251,平均0.3121,遗传一致度的变化范围为0.4843-0.9265,平均0.7465.其中,北方春糜子区和黄土高原春夏糜子区的遗传距离最小,遗传一致度最高,亲缘关系较近.UPGMA聚类分析显示,北方春糜子区和黄土高原春夏糜子区的材料聚为一类,个体间聚类,东北春糜子区的育成品种和农家种聚类结果一致,黄土高原春夏糜子区的育成品种在多个组群中都有出现.通过绘制K与△K的关系图,K=4时,△K最大,据此将131份糜子材料划分为4个类群,类群Ⅰ代表北方春糜子区;类群Ⅱ主要来自东北春糜子区;类群Ⅲ主要是北方春糜子区,群组Ⅳ主要是黄土高原春夏糜子区.各群体中大部分品种亲缘关系单一,少数品种含有其他组群的遗传成分.基于遗传距离的聚类分析与群体遗传结构分析结果基本一致,表明糜子的遗传差异与地理来源相关.[结论]北方春糜子区和黄土高原春夏糜子区的遗传多样性比较丰富,东北春糜子区的育成品种主要以农家种为遗传背景选育而来,黄土高原春夏糜子区在育种过程中引种资源广泛,与其他生态区存在基因交流.

分类号： S516

  • 相关文献

[1]罗汉果遗传多样性与群体结构及核心种质研究. 莫长明,谢文娟,郭文锋,张燕玲,黄江,张馨丹,李忠,唐其,马小军. 2023

[2]42份云南玉米自交系基于SSR荧光标记的遗传多样性分析. 张鹏,管俊娇,黄清梅,王江民,杨晓洪,刘艳芳,张建华,毛进. 2019

[3]百合资源抗棉蚜性鉴定及遗传多样性分析. 周俐宏,石慧,杨迎东,崔玥晗,杨盼盼,徐雷锋,明军. 2021

[4]基于SSR荧光标记构建睡莲核心种质. 苏群,王虹妍,刘俊,李春牛,卜朝阳,林玉玲,卢家仕,赖钟雄. 2023

[5]基于SSR标记的文冠果遗传多样性分析及指纹图谱构建. 李思琪,张文臣,杨柳,付庆新,洪新,张海旺. 2024

[6]利用SSR荧光标记分析90个糯玉米地方品种的遗传多样性. 雍洪军,张世煌,张德贵,李明顺,李新海,郝转芳,刘晓鑫,白丽,谢传晓. 2009

[7]利用SSR荧光标记分析山西糯玉米农家种的遗传多样性. 李锐,白建荣,张丛卓,张效梅,闫蕾,杨瑞娟. 2016

[8]甘蓝型油菜核心种质和新品种(系)的SSR等位变异分析. 周梦妍,吴金锋,许鲲,李锋,陈碧云,伍晓明. 2015

[9]中国东北地区绿豆种质资源遗传多样性的SSR分析. 赵雅楠,王颖,张东杰,王丽侠,佐兆杭. 2017

[10]基于SSR荧光标记分析我国主要审(认)定烤烟及白肋烟品种遗传多样性. 陈雅琼,王卫峰,丁安明,宗鹏,李凤霞,张磊,孙玉合. 2013

[11]基于SSR荧光标记的79份桃种质遗传多样性分析. 王璐伟,沈志军,李贺欢,潘磊,牛良,崔国朝,曾文芳,王志强,鲁振华. 2022

[12]SSR荧光标记毛细管电泳分析24个广西常规香稻品种的遗传多样性. 唐梅,孙富,何聪,卢宏琮,黄鹂,夏秀忠,唐忠平,钟志坚,陆桂耀. 2023

[13]基于SSR的中国糜子遗传多样性分析. 季煦,王瑞云,曳水瑛,刘晓欢,杨阳,刘笑瑜,连帅. 2015

[14]糜子EST-SSR分子标记的开发及种质资源遗传多样性分析. 何杰丽,石甜甜,陈凌,王海岗,高志军,杨美红,王瑞云,乔治军. 2019

[15]利用荧光SSR分析中国糜子遗传多样性. 王瑞云,季煦,陆平,刘敏轩,许月,王纶,王海岗,乔治军. 2017

[16]用高基元微卫星标记分析中国糜子遗传多样性. 王瑞云,刘笑瑜,王海岗,陆平,刘敏轩,陈凌,乔治军. 2017

[17]糜子农艺性状的遗传多样性分析. 刘峰. 2010

[18]甘肃省糜子地方资源农艺性状遗传多样性分析. 董孔军,杨天育,何继红. 2012

[19]33份糜子主要农艺性状的遗传多样性分析. 李涛,杨文耀,高瑞晓,高志军. 2023

[20]利用微卫星标记分析糜子资源的遗传多样性. 杨鹏凯,王瑞云,韩强,陆平,刘敏轩,许月,王纶,王海岗,乔治军. 2017

作者其他论文 更多>>

微信小程序