番茄查尔酮合成酶基因的鉴定及生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 阮美颖

作者： 阮美颖;万红建;叶青静;王荣青;姚祝平;周国治;俞锞;袁伟;刘云飞;杨悦俭

作者机构：

关键词： 番茄;查尔酮合成酶;生物信息学;表达分析

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2013 年 003 期

页码： 379-384

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 类黄酮(Flavonoids)是植物体内一类重要的次生代谢产物,它以结合态(黄酮苷)或自由态(黄酮苷元)形式存在于水果、蔬菜、豆类和茶叶等许多植物中,对植物的生长发育有着重要的调节作用.查尔酮合成酶(Chalcone synthase,CHS,EC2.3.1.74)是植物类黄酮合成途径的第一个关键酶,在调控类黄酮的生物合成以及类黄酮的成分起着决定作用.本研究基于番茄全基因组测序数据,利用生物信息学方法,鉴定了查尔酮合成酶基因家族成员,分析其内含子-外显子的结构特征、系统发育关系,序列结构的保守性以及染色体上的分布.研究表明:查尔酮合成酶(SlCHS)是含有8个成员的多家族基因,蛋白质序列编码位于160(SlCHS05)~438(SlCHS08)个氨基酸之间;相似性在33.7%(SlCHS02和SlCHS06)~92.0%(SlCHS04和SlCHS07)之间,表明这些序列之间具有较高的遗传多样性;此外,结构分析发现这些基因均含有较少的内含子(0~2个);序列比对表明这些基因具有较高的保守性;它们不均匀分布在番茄的1、5、6、9和12号染色体上.该研究不仅有助于未来了解该基因家族的进化起源提供参考,而且可为我们进一步分析该基因家族成员的功能奠定基础.

分类号： S641.2

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