基于线粒体基因组D-loop区全序列分析安义瓦灰鸡遗传多样性及其起源进化关系

文献类型： 中文期刊

第一作者： 高玉时

作者： 高玉时;贾晓旭;唐修君;唐梦君;樊艳凤;陆俊贤;顾荣;葛庆联;苏一军

作者机构：

关键词： 安义瓦灰鸡;线粒体DNA;D-loop区;系统发育关系;起源

期刊名称： 农业生物技术学报

ISSN： 1674-7968

年卷期： 2015 年 23 卷 07 期

页码： 940-944

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 本研究旨在探究江西安义瓦灰鸡(Gallus gallus domestiaus)的遗传多样性和起源。对30只安义瓦灰鸡线粒体基因组(mitochondrial genome,mt DNA)D-loop区全序列的进行PCR扩增和测序(Gen Bank登录号:KP893677~KP893682),并结合Gen Bank中红色原鸡的D-loop区序列,分析安义瓦灰鸡线粒体多态性及其起源。结果发现,安义瓦灰鸡mt DNA D-loop区全长1 231~1 232 bp,核苷酸多样性(Pi)为(0.006 13±0.000 14),单倍型多样性(Hd)为(0.837±0.027)。在30只个体中,共发现18处单核苷酸多态位点,6种单倍型。系统发育分析发现,6种单倍型可以分为A、B、C 3个分支,其中C为主要分支,有3种单倍型,A分支有1种倍型,B分支有2种倍型。A和B分支与红色原鸡滇南亚种(Gallus gallus spadiceus)聚为一类,C分支与4个原鸡亚种聚为一类。研究结果表明,安义瓦灰鸡mt DNA D-loop区有丰富的多态性,并且有多个母系起源,从分子水平上为安义瓦灰鸡的遗传资源保护和开发利用提供了参考。

分类号： S831

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