番茄20S蛋白酶体基因家族鉴定及生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 闫超凡

作者： 闫超凡;孙雪梅;钟启文;邵登魁;邓昌蓉;文军琴

作者机构：

关键词： 番茄;20S蛋白酶体;泛素—蛋白酶体系统;生物信息分析

期刊名称： 园艺学报

ISSN： 0513-353X

年卷期： 2024 年 002 期

页码： 266-280

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 20S蛋白酶体能够通过自身或泛素—蛋白酶体系统特异性降解细胞质和细胞核中的蛋白质，维持细胞蛋白质稳态。本研究中鉴定出21个番茄（Solanum lycopersicum L.）20S蛋白酶体基因家族成员，并对其进行生物信息分析。结果表明，番茄20S蛋白酶体大多数基因含有相似的启动子和内含子，其中，编码α亚基的基因保守性较好，而编码β亚基的基因保守性较差；亚细胞定位发现，绝大多数基因在细胞质中发挥功能；染色体定位和基因复制分析发现，21个20S蛋白酶体基因不均匀地分布在12条染色体上，存在2对片段复制基因对；进化分析表明，编码α亚基和编码β亚基的基因被划分在不同的类群或亚群；多物种共线性分析发现，番茄与辣椒（Capsicum annuum L.）和马铃薯（Solanum tuberosum L.）之间的同源基因对较多，而与拟南芥[Arabidopsis thaliana（L.）Heynh.]、水稻（Oryza sativa L.）和玉米（Zea mays L.）同源的基因对较少。SlPRA1-01、SlPRA10-04、SlPRA11-05和SlPRA16-09这4个基因在3个物种中均形成基因对；启动子和组织特异性表达分析结果显示，20S蛋白酶体基因家族在番茄逆境胁迫和生长发育中发挥着重要作用。

分类号： S641.2

  • 相关文献

[1]小偃麦异附加系TaTGA4转录因子基因的克隆与生物信息学分析. 牛祖彪,李娜,惠文荣,宋静,黄春丽,高居荣,王洪刚,封德顺. 2015

[2]动物胃肠道菌群的研究进展. 王津,燕晓翠,韩烨,周志江,刘红星,陈宝永,郑成江,邹旸,范寰. 2017

[3]牦牛miR-378前体克隆及组织表达分析. 纪会,王会,柴志欣,王吉坤,罗晓林,姬秋梅,信金伟,钟金城. 2019

[4]辣椒蔗糖转运蛋白基因生物信息学及表达模式分析. 李宁,尹延旭,王畅,王飞,姚明华,范书云. 2024

[5]转录组荔枝Dof基因家族的鉴定及其表达. 董晨,魏永赞,王弋,郑雪文,李伟才. 2021

[6]甘蓝型油菜SnRK基因家族生物信息学分析及其与种子含油量的关系. 唐婧泉,王南,高界,刘婷婷,文静,易斌,涂金星,傅廷栋,沈金雄. 2021

[7]番木瓜赖氨酸基序类受体激酶LysM-RLK基因家族鉴定及生物信息学分析. 郭盼,孔华,王雨,戴云素,贾瑞宗,周瑶,郭安平,纪长绵,马春花. 2023

[8]油棕SAUR基因家族的全基因组鉴定及生物信息学分析. 周丽霞,杨蒙迪,曹红星,杨耀东. 2022

[9]新型牡蛎相关圆环病毒基因组的鉴定. 杨李玲,郭迎香,位红颖,王萌,方艺菲,朱鹏,姜敬哲. 2022

[10]火龙果F-box基因家族的结构分析及表达鉴定. 王周雯,王猛,丁一,韦双双,谢俊,黄家权,李洪立,胡文斌,汤华. 2023

[11]鸭源H5N1亚型高致病性禽流感病毒的分离鉴定及其HA和NA基因的生物信息分析. 孙恩成,刘春国,侯喜林,刘明,朴范泽. 2009

[12]甘蓝型油菜γ-谷氨酰半胱氨酸合成酶(GCS)基因的克隆及生物信息分析. 贺晓岚,王建伟,陈新宏,李文旭,秦绍钊. 2023

[13]环境变化对水稻osfh1突变体成蛋白家族表达的影响. 李斌,李明玉,杜志烨,汪开顺,肖凯,王鑫,石杨,姬红丽,陈稷,黄进. 2022

[14]椰子GPAT基因家族的鉴定及生物信息学分析. 周倩倩,张照华,弓淑芳,夏志辉. 2024

[15]甘蓝型油菜组蛋白乙酰转移酶Bn-HAM2基因的克隆及生物信息学分析. 王建伟,贺晓岚,李文旭,秦绍钊,汤宏,余星. 2022

[16]小麦TaTVP1基因的克隆与表达分析. 马燕斌,李换丽,文晋,王霞,周仙婷,王新胜. 2023

[17]基于转录组的荔枝ARF基因家族的鉴定及表达分析. 董晨,魏永赞,王弋,郑雪文,李伟才. 2017

[18]基于转录组的荔枝XTH家族基因的鉴定及分析. 董晨,魏永赞,王弋,郑雪文,李伟才. 2019

[19]芥菜Trihelix转录因子家族全基因组鉴定分析. 李魁印,段丽丽,胡云,李伟,付文苑,杨巍,唐兵,常向彩. 2025

[20]不同育苗基质对番茄和辣椒幼苗生长的影响. 张彦良,张建国. 2015

作者其他论文 更多>>

微信小程序