番茄20S蛋白酶体基因家族鉴定及生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 闫超凡

作者： 闫超凡;孙雪梅;钟启文;邵登魁;邓昌蓉;文军琴

作者机构：

关键词： 番茄;20S蛋白酶体;泛素—蛋白酶体系统;生物信息分析

期刊名称： 园艺学报

ISSN： 0513-353X

年卷期： 2024 年 002 期

页码： 266-280

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 20S蛋白酶体能够通过自身或泛素—蛋白酶体系统特异性降解细胞质和细胞核中的蛋白质，维持细胞蛋白质稳态。本研究中鉴定出21个番茄（Solanum lycopersicum L.）20S蛋白酶体基因家族成员，并对其进行生物信息分析。结果表明，番茄20S蛋白酶体大多数基因含有相似的启动子和内含子，其中，编码α亚基的基因保守性较好，而编码β亚基的基因保守性较差；亚细胞定位发现，绝大多数基因在细胞质中发挥功能；染色体定位和基因复制分析发现，21个20S蛋白酶体基因不均匀地分布在12条染色体上，存在2对片段复制基因对；进化分析表明，编码α亚基和编码β亚基的基因被划分在不同的类群或亚群；多物种共线性分析发现，番茄与辣椒（Capsicum annuum L.）和马铃薯（Solanum tuberosum L.）之间的同源基因对较多，而与拟南芥[Arabidopsis thaliana（L.）Heynh.]、水稻（Oryza sativa L.）和玉米（Zea mays L.）同源的基因对较少。SlPRA1-01、SlPRA10-04、SlPRA11-05和SlPRA16-09这4个基因在3个物种中均形成基因对；启动子和组织特异性表达分析结果显示，20S蛋白酶体基因家族在番茄逆境胁迫和生长发育中发挥着重要作用。

分类号： S641.2

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