St基因组中的CRW同源序列在偃麦草中的FISH分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 陆坤

作者： 陆坤;徐柱;刘朝;张学勇

作者机构：

关键词： 偃麦草属;着丝粒;近着丝粒;反转录转座子;荧光原位杂交

期刊名称： 遗传

ISSN： 0253-9772

年卷期： 2009 年 31 卷 11 期

页码： 1141-1148

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为了确定十倍体长穗偃麦草(Thinopyrum ponticum,Liu&Wang)和六倍体中间偃麦草(Th.intermedium,[Host]Barkworth&Dewey)的基因组组成,根据野生一粒小麦(Triticum boeoticum)着丝粒自主型反转录转座子(CRW)序列设计特异引物,以二倍体拟鹅观草(Pseudoroegneria spicata,áLve)基因组DNA为模板进行PCR扩增,筛选到一条St基因组着丝粒区相对特异反转录转座子的部分序列pStC1,长度为1.755kb(GenBank登录号:FJ952565),其中有800bp与小麦着丝粒反转录转座子(CRW)的LTR区高度同源,另有小部分片段与其外壳蛋白编码基因(gag)部分同源,并且包含一段富含AGCAAC碱基的重复序列。以pStC1为探针,对十倍体长穗偃麦草的FISH检测结果显示其基因组组成为两个St组3个E组(St1St2EeEbEx);pStC1与中间偃麦草杂交时,不仅St基因组上有强烈的荧光信号,而且E基因组一些染色体的近着丝粒区域也有杂交信号,说明偃麦草属异源多倍体物种在其形成及进化过程中St与E基因组之间在着丝粒及近着丝粒相关区域可能存在协同进化。

分类号： S512.1

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