6株A型口蹄疫病毒结构蛋白VP1（1D）基因的核苷酸序列分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 刘再新

作者： 刘再新;赵启祖;刘卫;周鹏程;朱彩珠;常惠芸;谢庆阁

作者机构：

关键词： A型口蹄疫病毒;病毒结构蛋白VP1;核苷酸序列

期刊名称： 病毒学报

ISSN： 1000-8721

年卷期： 1998 年 14 卷 1 期

页码： 60

收录情况： CSCD

摘要： 早期收集保藏的6株A型口蹄疫病毒(FMDV)(AL1-AL6),适应BHK21单层细胞后,提取6株细胞增殖病毒的RNA。用一对FMDV通用引物经反转录(RT)-PCR法扩增了约500bp的期望的DNA片段。克隆目的基因后,采用双脱氧DNA链末端终止法测得了6株病毒的VP1基因210-639核苷酸序列。分析表明,3株病毒缺失3个核苷酸,从推导的氨基酸序列比较,确定缺失的3个核苷酸正好是一个密码子,位于氨基酸序列的152或156位。6株病毒的VP1核苷酸序列的同源率是91%-98%,相应氨基酸序列的同源率为92.6%-97.5%。结果显示,核苷酸差异的频率高时,相应氨基酸的改变频度亦高。6株病毒VP1基因的核苷酸序列与已报道的A型FMDV A22的同源性较好(84%)。6株病毒的主要中和抗原位点VP1 140-160位氨基酸序列差异较小,可能有相近的中和单抗表位和相同的抗原性。Goldkey软件分析表明,6株病毒间的遗传关系密切,在遗传系谱树上邻接。

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