感染"褐色沉积症"虾夷扇贝的外套膜转录组测序及差异表达基因分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 于佐安

作者： 于佐安;李大成;李华琳;刘项峰;滕炜鸣;刘忠颖;王庆志;周遵春

作者机构：

关键词： 虾夷扇贝;褐色沉积症;转录组;关键基因

期刊名称： 中国水产科学

ISSN： 1005-8737

年卷期： 2023 年 003 期

页码： 284-296

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为分析“褐色沉积症”形成分子机制,探究筏式养殖虾夷扇贝（Mizuhopecten yessoensis）贝壳内侧褐色沉积症状形成原因,采用Illumina高通量测序平台对感染“褐色沉积症”虾夷扇贝和健康虾夷扇贝外套膜组织进行转录组测序分析。结果显示,患病和健康扇贝外套膜分别获得43862251和41806737条clean reads。经参考基因组比对分析,患病和健康扇贝外套膜表达基因数量分别为17835个和16816个,差异表达基因208个,其中上调基因170个,下调基因38个。选取6个差异表达基因进行荧光定量PCR （q RT-PCR）验证,结果证明转录组测序分析可靠。GO功能富集发现差异基因主要富集在几丁质代谢、含氨基葡萄糖化合物代谢、几丁质结合和氨基糖代谢等与几丁质合成代谢相关的通路;KEGG通路富集分析发现差异基因主要参与内质网蛋白质合成、内吞作用、剪接体和谷胱甘肽代谢等途径;对差异表达倍数显著的前40个基因分析发现,编码类咖啡酰辅酶A-O-甲基转移酶（caffeoyl-Co A O-methyltransferase-like,CCOAOMT-L）、类1-氨基环丙烷-1羧酸合酶（1-aminocyclopropane-1-carboxylate synthaselike protein,ACCS-L）、黄蛋白（protein yellow-like）、热休克蛋白70 （HSP70）、过氧化物酶成熟因子（DUOXA1）、多烯脂肪酸异构酶（poly enoic fatty acid isomerase,PFI）、Na+/Cl+依赖的甘氨酸转运蛋白（sodium-and chloride-dependent glycine transporter,Gly T1）、类酪氨酸酶（putative tyrosinase-like protein,Putative Tyr-3）、Toll样受体（protein toll）等与蛋白质醌鞣化、免疫、氧化、神经传递相关的基因与褐色沉积症形成密切相关,揭示了虾夷扇贝外套膜褐色沉积症形成的内在原因。

分类号： S944.43

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