感染"褐色沉积症"虾夷扇贝的外套膜转录组测序及差异表达基因分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 于佐安
作者: 于佐安;李大成;李华琳;刘项峰;滕炜鸣;刘忠颖;王庆志;周遵春
作者机构:
关键词: 虾夷扇贝;褐色沉积症;转录组;关键基因
期刊名称: 中国水产科学
ISSN: 1005-8737
年卷期: 2023 年 003 期
页码: 284-296
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 为分析“褐色沉积症”形成分子机制,探究筏式养殖虾夷扇贝(Mizuhopecten yessoensis)贝壳内侧褐色沉积症状形成原因,采用Illumina高通量测序平台对感染“褐色沉积症”虾夷扇贝和健康虾夷扇贝外套膜组织进行转录组测序分析。结果显示,患病和健康扇贝外套膜分别获得43862251和41806737条clean reads。经参考基因组比对分析,患病和健康扇贝外套膜表达基因数量分别为17835个和16816个,差异表达基因208个,其中上调基因170个,下调基因38个。选取6个差异表达基因进行荧光定量PCR (q RT-PCR)验证,结果证明转录组测序分析可靠。GO功能富集发现差异基因主要富集在几丁质代谢、含氨基葡萄糖化合物代谢、几丁质结合和氨基糖代谢等与几丁质合成代谢相关的通路;KEGG通路富集分析发现差异基因主要参与内质网蛋白质合成、内吞作用、剪接体和谷胱甘肽代谢等途径;对差异表达倍数显著的前40个基因分析发现,编码类咖啡酰辅酶A-O-甲基转移酶(caffeoyl-Co A O-methyltransferase-like,CCOAOMT-L)、类1-氨基环丙烷-1羧酸合酶(1-aminocyclopropane-1-carboxylate synthaselike protein,ACCS-L)、黄蛋白(protein yellow-like)、热休克蛋白70 (HSP70)、过氧化物酶成熟因子(DUOXA1)、多烯脂肪酸异构酶(poly enoic fatty acid isomerase,PFI)、Na+/Cl+依赖的甘氨酸转运蛋白(sodium-and chloride-dependent glycine transporter,Gly T1)、类酪氨酸酶(putative tyrosinase-like protein,Putative Tyr-3)、Toll样受体(protein toll)等与蛋白质醌鞣化、免疫、氧化、神经传递相关的基因与褐色沉积症形成密切相关,揭示了虾夷扇贝外套膜褐色沉积症形成的内在原因。
分类号: S944.43
- 相关文献
[1]筏式养殖虾夷扇贝"褐色沉积症"形成原因初步研究. 于佐安,李大成,王庆志,李华琳,于笛,刘项峰,滕炜鸣,王笑月,周遵春. 2022
[2]黄秋葵果实质地变化的生化和转录组联合分析. 张国芹,牟建梅,陈虎根. 2023
[3]植物黄酮醇生物合成关键基因研究进展. 方芳,王凤忠. 2018
[4]利用加权基因共表达网络分析方法挖掘香菇发育不同阶段的关键基因. 宋婷婷,沈颖越,徐飞,范丽军,蔡为明. 2021
[5]草莓维生素C合成机制及其含量影响因素研究进展. 孙灵敏,刘艳芬,魏灵芝,高用顺. 2023
[6]梅和杏果实有机酸代谢差异研究. 翁金洋,薛松,倪照君,阎依超,沈志军,高志红. 2018
[7]玫瑰挥发性香气成分研究进展. 赵艳侠,赵玉龙,张晶莹,刘艳,孙骏飞,李益. 2023
[8]作物驯化和品种改良所选择的关键基因及其特点. 张学勇,马琳,郑军. 2016
[9]梅和杏果实有机酸代谢差异研究. 翁金洋,薛松,倪照君,阎依超,沈志军,高志红. 2018
[10]昆虫性别决定级联的研究进展. 刘雅婷,王文璐,陈宗泽,谢文,张友军. 2023
[11]红掌佛焰苞数字基因表达谱及关键基因表达水平分析. 彭佳佳,刘克林,刘丽娅,吕学华,杨哲,李佩愉,刘春,明军,袁素霞,平吉成,张黎. 2016
[12]作物驯化和品种改良所选择的关键基因及其特点. 张学勇,马琳,郑军. 2017
[13]虾夷扇贝的摄食生理研究. 徐东,张继红,王文琪,董美涛,王忠. 2010
[14]虾夷扇贝对牙鲆的粪便、残饵及网箱养殖区沉积物的摄食. 张继红,吴桃,徐东,高亚平,唐望. 2013
[15]两种壳色虾夷扇贝的RAPD分析. 孙秀俊,杨爱国,刘志鸿,周丽青. 2009
[16]两种壳色虾夷扇贝的同工酶分析. 孙秀俊,杨爱国,刘志鸿,周丽青,王卫军. 2009
[17]基于遗传连锁图谱筛选虾夷扇贝性别相关AFLP分子标记的方法. 周丽青,杨爱国,刘志鸿,王清印,吴彪,孙秀俊,郑利兵,郑言鑫. 2014
[18]虾夷扇贝寄生短触手才女虫的形态与组织切片观察. 唐彬,叶灵通,曹超,杨宝丽,王江勇. 2015
[19]虾夷扇贝(Patinopecten yessoensis)对铅和镉的生物富集与释放规律. 崔正国,苑旭洲,崔毅,陈碧鹃,李永霞,梁峻,赵学伟. 2015
[20]虾夷扇贝动态能量收支生长模型. 张继红,吴文广,刘毅,蔺凡,王巍,牛亚丽. 2017
作者其他论文 更多>>
-
长牡蛎AMPK基因在三倍体性腺发育中的表达特性及调控机制
作者:王朔;于红;李琪;王庆志
关键词:长牡蛎;性腺发育;AMPK基因;三倍体;调控机制
-
海参皂苷结构特征及其生物活性和作用机制研究进展
作者:刘煜珺;郑杰;刘东竹;于笛;李龙;傅志宇;刘桂英;周遵春
关键词:海参皂苷;结构特征;生物活性;作用机制
-
大沽全海笋的营养成分分析与评价
作者:傅志宇;李大成;白永安;于笛;于喆;王庆志;郑杰
关键词:大沽全海笋;营养成分;脂肪酸;氨基酸;矿物质
-
基于虾夷扇贝自交家系的双列杂交配合力分析
作者:赵亮;高杉;蒋经伟;周遵春
关键词:虾夷扇贝;双列杂交;一般配合力;特殊配合力;自交
-
虾夷扇贝F1自交衰退及其遗传调控机理
作者:赵亮;李仰平;高杉;姜苹哲;林杉杉;张国瀚;范广其;蒋经伟;周遵春
关键词:虾夷扇贝;自交;适合度;偏分离;近交衰退
-
季节变化对仿刺参Toll样受体信号通路基因表达的影响
作者:肖瑶;高杉;赵泽龙;蒋经伟;周遵春
关键词:仿刺参;TLR信号通路;MyD88依赖途径;MyD88非依赖途径;转录表达;季节性变化
-
半裸舟形藻的优化培养及在仿刺参养殖中的应用
作者:王笑月;王旭达;刘卫东;谢玺;宋广军;李石磊;董颖;周遵春
关键词:半裸舟形藻;仿刺参;生长表现;酶活性