香蕉NINV基因家族鉴定及分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 吴建阳
作者: 吴建阳;陈妹;唐路平;胡会刚;武爱龙;张秀梅
作者机构:
关键词: 香蕉;碱性/中性转化酶;基因家族;生物信息学;鉴定
期刊名称: 热带农业科学
ISSN: 1009-2196
年卷期: 2024 年 44 卷 011 期
页码: 50-56
摘要: 碱性/中性转化酶(Alkaline/neutralinvertase,NINV)能专一性地催化蔗糖水解成葡萄糖和果糖,NINV由基因家族编码。在多个物种中已鉴定出NINV基因家族所有成员,但香蕉中至今尚未有NINV基因家族的报道。本研究借助于香蕉基因组,共分离到12个NINV基因,分别命名为MaNINV1~12,分布于chr2、chr3、chr5、chr6、chr7、chr8、chr9、chr11等8条染色体上,氨基酸序列长度为531~701 aa,分子量为60.62~79.22 kD,理论等电点为5.91~7.19。进化树分析发现,有5个NINV基因属于α亚族,即MaNINV1、MaNINV2、MaNINV6、MaNINV9、MaNINV10;7个NINV基因属于β亚族,即MaNINV3、MaNINV4、MaNINV5、MaNINV7、MaNINV8、MaNINV11、MaNINV12。香蕉NINV基因家族成员外显子数量为4~8,内含子数量为3~7。香蕉NINV基因家族启动子顺式作用元件中,激素响应元件最多,其次为光响应元件,胁迫响应元件最少;与激素相关的元件有6类,分别为脱落酸、生长素、茉莉酸甲酯、赤霉素、玉米素、水杨酸。本研究可为后续阐明NINV与蔗糖的关系提供基础。
分类号: S668.1
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