中国4省猕猴桃细菌性溃疡病菌的生物型检测和遗传多样性分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 代玉立

作者： 代玉立;兰成忠;甘林;刘晓菲;龚国淑;杨秀娟

作者机构： 福建省农业科学院植物保护研究所福建省作物有害生物监测与治理重点实验室福建省作物有害生物绿色防控工程研究中心;四川农业大学农学院

关键词： 猕猴桃细菌性溃疡病菌;生物型;遗传多样性;多基因联合分析;猕猴桃

期刊名称： 植物保护

ISSN： 0529-1542

年卷期： 2022 年 006 期

页码： 58-68

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 由丁香假单胞菌猕猴桃致病变种Pseudomonas syringae pv.actinidiae（Psa）侵染引起的猕猴桃细菌性溃疡病（kiwifruit bacterial canker）是全球猕猴桃生产上最具毁灭性的细菌病害。为探明福建、安徽、四川和陕西4省Psa菌株的生物型和遗传多样性，用5对PCR特异性引物PsaJ-F/-R、PsaK-F/-R、Tac-F/-R、Con002-F/-R和avrRps4-F1/-R2检测Psa菌株的生物型；用4对PCR引物27F/1492R、PsaF1/R2、gapA-Fps/Rps和rpoD+364s/-1222ps分别扩增16S rRNA、ITS、gapA和rpoD基因，进行多基因联合分析Psa菌株的遗传多样性。结果表明，特异性引物Tac-F/-R从47株Psa菌株中均能扩增出一条545 bp的特异条带，其他4对引物未扩增出任何条带，说明供试Psa菌株的生物型均为biovar 3。多基因联合分析表明，4省Psa存在丰富的遗传多样性，4个群体共检测出27个单倍型，单倍型多样性为0.955。安徽、福建、四川和陕西群体的单倍型数差异较大，分别为1、8、12个和12个。4个群体的多态性位点数、核苷酸多样性和平均核苷酸差异数差异极显著（P＜0.01）,其中福建群体的多态性最丰富，而安徽群体的多态性最低。AMOVA分析表明，3.6%的遗传变异来源于种群间，而96.4%的遗传变异来源于种群内，说明种群内变异是遗传变异的主要来源。遗传分化分析表明，安徽省Psa群体与其他3个群体间的遗传分化极高(Fst＞0.175),福建、四川和陕西群体间的遗传分化水平较低(Fst＜0.017)。研究结果有利于了解福建省Psa的来源，为阻断Psa的传播和猕猴桃细菌性溃疡病的长期可持续控制提供了理论参考。

分类号： S436.634.1

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