文献类型： 中文期刊
第一作者： 侯景
作者： 侯景;申超超;张大俊;杨博;史喜绢;张婷;崔卉梅;袁兴国;赵登率;陈学辉;张克山;郑海学;刘湘涛
作者机构：
关键词： 非洲猪瘟病毒;解旋酶;D1133L基因;序列分析;结构预测;亚细胞定位
期刊名称： 畜牧兽医学报
ISSN：
年卷期： 2021 年 007 期
页码： 1953-1962
收录情况： 北大核心 ; CSCD
摘要： 旨在通过预测分析和亚细胞定位研究非洲猪瘟病毒（ASFV）D1133L基因结构、亚细胞定位与功能间的关系。作者使用Mega6.0软件绘制了7株不同基因型的D1133L解旋酶和ASFV编码的其他5个解旋酶基因的系统进化树,使用EXPASY、PRABI和SWISS-MODEL软件预测了该基因所编码蛋白序列的二、三级结构;根据GenBank公布的ASFV序列（LR743116.1）,合成D1133L基因并构建其重组真核表达质粒pCMV-D1133L,蛋白免疫印迹（Western blot, WB）验证该基因表达后,将重组质粒转染至PK-15细胞,应用间接免疫荧光试验（indirect immunofluorescence assay, IFA）研究了该蛋白的亚细胞定位。结果表明,通过ASFV解旋酶的基因系统进化树,发现5种解旋酶基因均相对保守。D1133L基因全长3 402 bp,表达的蛋白为124.63 ku, G+C含量为6.1%,A+T含量为10.6%;二级结构分析表明α螺旋占48.90%,扩展链占13.50%,无规卷曲为33.27%;三级结构分析表明六自由度结构（six degree of freedom, QMQE）为0.20,覆盖率84%,且预测以α螺旋为主的高级结构;通过LOCSVMPSI分析预测,显示D1133L蛋白定位于细胞核内与细胞质内的概率是相同的。WB结果显示pCMV-D1133L质粒正常表达,IFA试验证明ASFV编码的解旋酶D1133L同时分布于细胞核和细胞质。本研究通过对D1133L基因序列、结构功能预测,并通过IFA验证了D1133L亚细胞分布,为进一步揭示D1133L基因功能奠定了一定基础。
分类号： S852.651
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