斑点叉尾鮰Cbx基因家族的全基因组鉴定与进化分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 张世勇

作者： 张世勇;陈校辉;王明华;钟立强;秦钦;邵俊杰;刘洪岩;王江;边文冀;Jiang Hucheng

作者机构：

关键词： 斑点叉尾鮰;Cbx基因;Chromo结构域;基因家族

期刊名称： 基因组学与应用生物学

ISSN： 1674-568X

年卷期： 2019 年 04 期

页码： 1488-1496

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 利用Cbx家族基因高度保守的Chromo结构域氨基酸序列作为种子序列,检索斑点叉尾鮰(Ictalurus punetaus)基因组注释的蛋白数据库,共鉴定分离出14个Cbx基因。并在全基因组水平对斑点叉尾鮰Cbx基因家族进行了保守结构域序列、进化、基因结构、染色体定位的系统分析。本研究中鉴定出的斑点叉尾鮰Cbx家族基因蛋白序列与已知的人类、小鼠、鸡、斑马鱼等物种Cbx蛋白序列构建系统进化树。根据系统进化树分析结果,14个斑点叉尾鮰Cbx基因分成两个亚族,5个隶属于Hp1s亚族,9个隶属于PcGs亚族。Cbx基因主要分布于斑点叉尾鮰7条染色体中,且呈不均匀分布。本研究对于后续斑点叉尾鮰Cbx基因家族深入的功能验证及分子作用机制研究具有重要的意义,也为日益丰富的水产基因组资源的挖掘利用提供了参考。

分类号： S917.4

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