土壤宏基因组文库的构建及拮抗稻瘟菌克隆子的筛选

文献类型： 中文期刊

第一作者： 陈旭玉

作者： 陈旭玉;周亚奎;余贤美;林春花;郑服丛

作者机构：

关键词： 宏基因组文库;拮抗;稻瘟菌;筛选

期刊名称： 西北农业学报

ISSN： 1004-1389

年卷期： 2009 年 18 卷 01 期

页码： 165-169

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 从橡胶林土壤中提取微生物总DNA,用PstI酶切后,酶切液与pBluescriptKS+载体连接转入大肠杆菌,构建了包含7 680个克隆子的宏基因组文库,76.2%的质粒含有外源DNA,插入片段的平均大小为4.3kb,DNA文库的容量为32.25MB。首先用序列筛选方法对土壤宏基因组文库进行筛选,共得到11个克隆子,通过对11个克隆子进行功能筛选(复筛),发现克隆子JKDL-1和JKDL-2对稻瘟菌有明显抑制作用,其余的9个克隆子对稻瘟菌没有明显活性。具有拮抗作用的克隆子通过NCBI的Blastx分析,发现JKDL-1和JKDL-2分别与柄杆菌属(Caulobactersp.K31)和布克氏菌属(Burkholderia ambifariaMC40-6)有75%和77%的同源性,初步预测其功能为组氨酸激酶(GAF sensor hybrid histidine kinase)和乙酰辅酶A乙酰转移酶(acetyl-CoA acetyltransferases)。

分类号： S435.111.41`S154

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