microRNA碱基编辑在不同蜱种间的差异特征分析

文献类型: 中文期刊

第一作者: 罗金

作者: 罗金;陈荣贵;赵卫东;陈泽;任巧云;陈秋语;刘小翠;殷宏;罗建勋;刘光远

作者机构:

关键词: 蜱;碱基编辑;编辑频率;种子序列;多样性

期刊名称: 中国动物学会寄生虫学专业委员会第十五次全国学术会议暨第六次国际寄生虫学学术研讨会论文摘要集

ISSN:

年卷期: 2015 年

页码: 1

收录情况: CSCD

摘要: 目的:保守microRNA(miRNA)是在真核生物中发现的一类内源性的具有调控功能的非编码RNA,其大小长约20~25个核苷酸,广泛存在于动植物细胞中。miRNA通过"种子序列"实现对靶标基因的识别,因此,其具有高度保守性。miRNA通过碱基编辑对多个靶标基因进行调控,这一现象决定了miRNA的多样性。为了分析蜱miRNA碱基编辑特征。方法:利用高通量测序方法对我国五个主要的蜱种(微小牛蜱,长角血蜱,银盾革蜱,小亚璃眼蜱,血红扇头蜱)进行miRNA测序。并将未注释上的小片段RNA序列与miRBase21(http://www.mirbase.org/index.shtml)中...

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