大豆耐涝bZIP转录因子Glyma06g08390的生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 林昊

作者： 林昊;徐靖;朱红林;唐力琼;林延慧;王效宁

作者机构：

关键词： 大豆;耐涝;转录组;bZIP转录因子;MAPK信号通路

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2022 年 20 卷 021 期

页码： 6970-6974

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： bZIP转录因子在响应不同非生物胁迫中起着重要作用.本研究以耐涝性强大豆品种'齐黄34'作为材料,对其进行没顶淹水处理,取样进行转录组测序,筛选出1个差异表达的bZIP转录因子Gly-ma06g08390,并对其进行RT-qPCR检测,结果与转录组测序数据趋势一致,呈现上调表达.分析Gly-ma06g08390蛋白的保守结构域,发现该蛋白内部含有bZIP保守结构域.蛋白三级结构中存在与寡聚化作用的亮氨酸拉链区.预测与Glyma06g08390蛋白互作的蛋白,结果发现有两个蛋白是MAPK信号通路中的蛋白,分别MAPK2和MAPKK2.因此,我们推测Glyma06g08390可能与MAPK2和MAPKK2发生互作,激发了 MAPK信号通路来响应涝害胁迫.

分类号： S565.1

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