菊分支NCED酶分子特征及进化分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 韦艳萍

作者： 韦艳萍;刘云飞;许桂梅;万红建;李志邈;叶青静;王荣青;阮美颖;姚祝平

作者机构：

关键词： 9-顺式-环氧类胡萝卜素双加氧酶;菊分支;生物信息学;进化

期刊名称： 核农学报

ISSN： 1000-8551

年卷期： 2015 年 29 卷 02 期

页码： 278-289

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为探究9-顺式-环氧类胡萝卜素双加氧酶(NCED)基因家族进化特性,本文利用生物信息学方法,对菊分支类群已完成测序的植物(包括番茄、马铃薯、烟草、甜菜、猴面花)基于全基因组进行NCED基因家族鉴定,并对其蛋白序列特征,保守基序,次级结构以及系统发育关系进行分析。结果表明,NCED酶是由小基因家族编码的酶,其成员为2~4个。蛋白质氨基酸大小在505~652aa之间,分子质量为56.23~71.42 k Da,除Sl NCED6外,其余各蛋白的等电点均表现为酸性,保守基序分析发现各成员均包含10个保守基序,其长度在29~50之间。此外,NCEDs蛋白结构分析显示,一级结构氨基酸序列N端保守性较低,而次级结构均表现为高度保守。系统发育关系发现,来自番茄的Sl NCED5、Sl NCED6与来自马铃薯的St NCED5、St NCED6分别为直系同源蛋白,这与生物学上的亲缘关系一致。

分类号： Q943

  • 相关文献

[1]甘蓝乙二醛酶基因家族的鉴定与表达分析. 张美丽,袁丽丽,张付贵,管文杰,闫贵欣,伍晓明. 2023

[2]大豆TOR家族全基因组鉴定及表达特征分析. 张中起,代名扬,李昆仑,吕令华,刘磊,曹嵩晓,李品,张震彪,薛墨庸. 2025

[3]小麦TaNCED1基因植物表达载体的构建. 西廷业,王洪刚,后猛,刘海燕,刘树兵. 2008

[4]亚洲棉NCED3基因克隆及其抗旱功能分析. 蔡肖,王海涛,李兴河,甄军波,刘琳琳,刘迪,迟吉娜,张建宏. 2022

[5]ABA对草莓果实成熟和软化的调节. 朱海生,温庆放,李永平,林珲,陈敏氡,李严曼. 2012

[6]猪流感的再认识. 仇华吉,童光志. 2000

[7]禾本科小麦族三个物种的核型及进化关系分析. 林小虎,李兴锋,王黎明,赵逢涛,王洪刚. 2005

[8]外生菌根菌植多样性及其进化. 桂阳,刘作易. 2006

[9]6个紫花苜蓿材料的核型及其亲缘关系分析. 张雪婷,杨文雄,杨芳萍,师尚礼,尹国丽. 2011

[10]芝麻染色体核型及似近系数分析. 张海洋,苗红梅,李春,魏利斌,马琴. 2012

[11]近百年来全球气候变暖的倾向和甲型流感病毒神经氨酸酶进化的倾向(英文). 左文朴,朱绮霞,黄艳燕,潘丽霞,吴光. 2010

[12]古菌、细菌和真核生物纤维素酶的整体进化关系（英文）. 吴光. 2016

[13]用微分方程组的解析解拟合甲型流感病毒聚合酶酸性蛋白家族的进化过程(英文). 吴光. 2010

[14]中国沙棘雌雄株的染色体核型分析. 王彬,朱春云,王志涛,辛永清. 2010

[15]中国沙棘染色体核型及进化研究. 王彬. 2011

[16]SOS应答系统及其对细菌耐药性和毒力的调控作用与在治疗细菌感染中的应用. 王进文,白华,颜世敢,胡明,刘玉庆. 2014

[17]基于Agent的植物生长系统体系结构. 李晓明,赵春江,郑萍. 2010

[18]家蚕杆状病毒半胱氨酸蛋白酶基因的序列分析及表达. 林旭瑷,张志芳,李卫国,何家禄,尚金燕. 2002

[19]大豆种质资源遗传多样性研究进展. 何真,韵晓东,武凯,姬虎太,常建忠,乔麟轶,郑军. 2015

[20]畜禽动物中长链非编码RNA的研究现状. 戴梦红,陆启荣,程古月,李丽,刘孟轲,郝海红,王旭,袁宗辉. 2016

作者其他论文 更多>>

微信小程序