基于NCBI数据库的油棕EST-SSR标记的开发与应用

文献类型： 中文期刊

第一作者： 夏薇

作者： 夏薇;肖勇;杨耀东;沈雁;雷新涛;马子龙

作者机构：

关键词： 油棕;SSR;多态性;平均遗传距离;遗传结构

期刊名称： 广东农业科学

ISSN： 1004-874X

年卷期： 2014 年 41 卷 02 期

页码： 144-148+166

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 应用NCBI网站上释放的41 977条油棕EST序列,从中挖掘SSR位点3 946个,根据27个SSR位点的侧翼序列设计引物,并对18份油棕DNA样品进行扩增,扩增结果显示10个标记具有多态性。根据这些标记信息,对这18份油棕资源进行主成分分析,18份油棕资源被分成两个遗传群体,一个为文昌高隆湾和文昌椰子研究所的油棕资源,另一个群体为10份引自马来西亚的油棕资源。这些研究显示,开发的标记可用于油棕资源遗传多样性评估、遗传结构评估,并可用于油棕遗传图谱的构建。

分类号： S565.9

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