半滑舌鳎抗哈维氏弧菌病相关微卫星标记筛选及QTL定位
文献类型: 中文期刊
第一作者: 戴欢
作者: 戴欢;刘洋;王文文;位战飞;高进;高峰涛;李祥孔;刘洋;陈松林
作者机构:
关键词: 半滑舌鳎;哈维氏弧菌;微卫星标记SSR;混合分离子分析法BSA;数量性状基因座QTL
期刊名称: 中国水产科学
ISSN: 1005-8737
年卷期: 2017 年 24 卷 01 期
页码: 22-30
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 为了筛选出与抗哈维氏弧菌病相关的微卫星标记并进行QTL定位,以2014年感染实验中存活率为52.22%的半滑舌鳎(Cynoglossus semilaevis)家系F1412(Family+年份+家系号)为材料,采用混合分离子分析法(bulked segregant analysis,BSA)对169个微卫星标记(SSR)进行筛选,得到1个可能与哈维氏弧菌病相关的微卫星标记scaffold479_23523。用scaffold479_23523所在的连锁群LG18上的37个SSR对94尾抗病、感病个体进行基因分型,得到3个图谱:整合图谱(LG18)、雌性图谱(LG18F)和雄性图谱(LG18M),并用两种不同的模式进行单标记分析和QTL定位。模式一得到3个显著性相关标记(P<0.05)和1个极显著性相关标记(P<0.01),图谱LG18F定位出一个区间qE-F1;模式二得到4个显著相关标记(P<0.05)和1个极显著相关标记(P<0.01),图谱LG18M定位出两个区间qE-M1、qE-M2。在全基因组序列的分布范围上,区间qE-F1包含了qE-M1及qE-M2,因此qE-F1更可能与抗病性状相关。本研究开发出了抗哈维氏弧菌病性状相关微卫星标记及QTL区间,为抗病新品种的培育奠定了基础。
分类号: S943
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