苏博美利奴羊S1OOA11基因序列分析及表达研究
文献类型: 中文期刊
第一作者: 付雪峰
作者: 付雪峰;刘春洁;黄锡霞;石刚;徐新明;石晓雷;田可川
作者机构:
关键词: 绵羊;S100A11基因;生物信息学;RT-PCR;显著性表达
期刊名称: 黑龙江畜牧兽医(上半月)
ISSN: 1004-7034
年卷期: 2016 年 006 期
页码: 15-19,283
收录情况: 北大核心
摘要: 为了探讨S100A11基因在苏博美利奴羊中不同类型细度的细毛羊中的表达模式,试验以苏博美利奴羊为研究对象,克隆了钙囊素S100A11基因,采用生物信息学方法进行遗传进化分析,对S100A11蛋白的理化性质进行分析,并对其二级蛋白结构进行预测,且通过RT-PCR相对定量方法检测S100A11基因在不同绵羊个体中的表达规律.结果表明:绵羊S100A11基因的CDS全长序列为866 bp,编码了105个氨基酸,与绵羊、山羊、牛、猪、鼠、兔、鸡、狗和斑马鱼的CDS同源性分别为96%、96%、96%、87%、24%、44%、70%、70%、60%;分别在1 bp、220 ~336 bp、415 ~864bp有3个开放式阅读框(ORF);S100A11基因全长为4 798 bp.S100A11蛋白含有1个信号肽、19个磷酸化位点;同时S100A11基因在超细型细毛羊皮肤组织表达量极显著高于细型细毛羊的表达量(P<0.01),差异倍数为2.048.
分类号: S826.8+6%Q87
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