大长杂交猪DJ-1基因克隆、生物信息学及表达分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 炊林亚

作者： 炊林亚;夏博策;黄娇娇

作者机构：

关键词： 猪;DJ-1基因;生物信息学分析;表达;脂肪

期刊名称： 中国畜牧兽医

ISSN： 1671-7236

年卷期： 2022 年 012 期

页码： 4513-4523

收录情况： 北大核心

摘要： 【目的】克隆大长杂交猪DJ-1基因CDS区并进行生物信息学分析，探讨DJ-1基因在猪脂肪组织中的表达规律，为后续探究该基因在猪脂肪沉积中的功能奠定基础。【方法】以大长杂交猪腹股沟皮下脂肪组织cDNA为模板，PCR扩增DJ-1基因CDS区，利用在线工具对DJ-1蛋白进行生物信息学分析；利用实时荧光定量PCR检测DJ-1基因在大长杂交猪、大白猪（瘦肉型猪）和莱芜猪（脂肪型猪）脂肪组织中的表达量，并比较表达差异。【结果】大长杂交猪DJ-1基因CDS区全长570 bp,编码189个氨基酸。系统进化树分析表明，大长杂交猪和牛亲缘关系最近，与斑马鱼亲缘关系最远。DJ-1蛋白分子质量为19.94 ku,是一种稳定的酸性、亲水性蛋白，且含有1个GAT＿1超家族成员Thij结构域；无信号肽和跨膜结构域，具有21个磷酸化位点、4个N-糖基化修饰位点和1个O-糖基化修饰位点。DJ-1蛋白二级结构由α-螺旋、延伸链、β-转角、无规则卷曲组成，占比分别为42.86%、17.99%、7.94%和31.22%,三级结构预测结果与其一致。蛋白互作分析发现，DJ-1蛋白可能与SOD2、NDUFV2、SNCA、BCL2L1和MAP3K等蛋白存在相互作用。实时荧光定量PCR结果表明，DJ-1基因在大长杂交猪背膘、腹股沟脂肪和肾周脂肪组织中均有表达，但无显著差异（P＞0.05）;且在大白猪脂肪组织中的表达量显著或极显著低于莱芜猪（P＜0.05;P＜0.01）。【结论】本研究成功克隆了大长杂交猪DJ-1基因CDS区，其编码蛋白属稳定的酸性、亲水性蛋白，在莱芜猪脂肪组织中的表达量显著或极显著高于大白猪。本试验结果为进一步研究猪DJ-1基因功能提供理论参考。

分类号： S828

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