基于全基因组数据解析伞菌目木质纤维素降解酶系的差异

文献类型： 中文期刊

第一作者： 杨瑞恒

作者： 杨瑞恒;李燕;唐利华;李传华;鲍大鹏

作者机构：

关键词： 基因组规模;伞菌目;碳水化合物活性酶;氧化还原酶

期刊名称： 菌物学报

ISSN： 1672-6472

年卷期： 2017 年 06 期

页码： 705-717

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 伞菌目Agaricales隶属于担子菌门Basidiomycota、伞菌亚门Agaricomycotina,是担子菌门中最大的一个类群,能够以腐生、寄生以及共生的模式在自然环境中生存,生存范围广,对于维持生态环境的平衡具有重要的作用。本研究基于51株伞菌目真菌基因组大数据挖掘降解木质纤维素相关的碳水化合物活性酶(carbohydrate-active enzymes,CAZymes)和氧化还原酶(oxidoreductases),同时比较白腐菌、褐腐菌、腐生菌、菌根菌、植物致病菌、兼性寄生菌、动物共生菌和不明生态型真菌降解机制的差异。结果显示白腐菌和褐腐菌等木腐菌、菌根菌、兼性寄生菌、其他腐生菌、植物致病菌以及共生菌的CAZymes家族平均数目为134个、93个、101个、127个、61个和32个,而CAZymes同源的基因平均数目为398个、240个、463个、407个、418个、131个和38个,木腐菌的CAZymes家族最为丰富,但是兼性寄生菌基因数目最多;同时具有木质纤维素降解酶活性的26个家族中,基因数目分别为86个、32个、101个、86个、104个、36个和10个。在木腐菌(白腐菌和褐腐菌)、菌根菌、兼性寄生菌、腐生菌、不明生态型、植物致病菌和动物共生菌中氧化还原酶相关的基因数目为44个、35个、48个、53个、59个、6个和29个,其中不明生态型真菌的基因数目最多达到了59个,植物致病菌的数量最少。CAZymes和氧化还原酶在不同的真菌中数量和种类差别很大,与其生态类型的关系不明显,此研究丰富了木质纤维素降解机制的多样性,但是需要进一步的实验设计对其生物活性进行验证以及进行蛋白家族进化分析。

分类号： Q949.32

  • 相关文献

[1]宁夏菌物物种多样性研究. 沈瑞清,商鸿生,查仙芳,南宁丽,王宽仓. 2007

[2]大丽轮枝菌(VerticilliumdahliaeVdLs.17)分泌组预测及分析. 田李,陈捷胤,陈相永,汪佳妮,戴小枫. 2011

[3]植物精油对产气荚膜梭菌感染肉仔鸡肠道损伤、肠道菌群CAZy谱和eggNOG通路的影响. 姜美涵,魏金涛,呙于明,郭双双,杜恩存. 2023

[4]大丽轮枝菌(Verticillium dahliae VdLs.17)分泌组预测及分析. 田李,陈捷胤,陈相永,汪佳妮,戴小枫. 2011

[5]比较基因组揭示广西酸菜乳杆菌碳水化合物活性酶谱. 彭明芳,李培骏,单杨,陈玉秋,杨岱峻,雷丽嫦,黄芝辉,余孔新. 2021

[6]斯氏假单胞菌Pseudomonas stutzeri A1501氧胁迫下基因表达谱研究. 窦岳坦,燕永亮,平淑珍,陆伟,陈明,张维,王忆平,金奇,林敏. 2008

[7]黄绿木霉T1O1O对日光温室耕层土壤酶活性的调控效应. 陈建爱,陈为京,杨焕明,祝文婷. 2013

[8]甘蔗酒精废液对土壤理化性状及氧化还原酶的影响. 李杨瑞,韦广泼,江泽普. 2009

[9]黄绿木霉T1010对日光温室耕层土壤酶活性的调控效应. 陈建爱,陈为京,杨焕明,祝文婷. 2013

[10]人工湿地基质氧化还原酶与净水效果的相关性. 余家辉,李冰,王林,朱加宾,朱健. 2018

[11]斯氏假单胞菌PseudomonasstutzeriA1501氧胁迫下基因表达谱研究. 窦岳坦,燕永亮,平淑珍,陆伟,陈明,张维,王忆平,金奇,林敏. 2008

作者其他论文 更多>>

微信小程序