猪嵴病毒福建株全基因克隆及序列分析

文献类型: 中文期刊

第一作者: 修金生

作者: 修金生;胡崇伟;陈如敬;王斌;李涛;陈秋勇;林群群

作者机构:

关键词: 猪嵴病毒;基因组;基因结构;序列分析

期刊名称: 中国人兽共患病学报

ISSN: 1002-2694

年卷期: 2013 年 29 卷 11 期

页码: 1076-1079

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 目的为研究猪嵴病毒(porcine kobuvirus,PKV)福建株的基因组结构特征。材料与方法根据猪嵴病毒基因组特征设计特异性引物,运用RT-PCR方法,对猪嵴病毒福建株进行全基因克隆,并运用RACE方法对猪嵴病毒福建株的5’和3’末端进行扩增。结果与结论所获得的猪嵴病毒福建株基因组全长为8 210bp,其5’末端长度为576bp,3’末端长度为167bp,编码一个大的多聚蛋白,长度为7 467bp,编码2 488个氨基酸。其多聚蛋白核苷酸同源性和我国猪嵴病毒分离株CH/HNXX-4/2012(GenBank登录号JX401523)同源性最高,均为89.2%,和匈牙利猪嵴病毒分离株swine/S-1-HUN/2007/Hungary(GenBank登录号(GenBank登录号EU787450)同源性最低,达87.6%。

分类号: R373`S852.65

  • 相关文献

[1]猪嵴病毒VP0基因的克隆与序列分析. 陈如敬,修金生,陈晓珞,吴学敏,车勇良,王晨燕,严山,王隆柏,周伦江. 2015

[2]3株鸭肝炎病毒1型全基因序列分析. 杨维星,施少华,陈红梅,万春和,程龙飞,傅光华,林芳,林建生,苏敬良,黄瑜. 2010

[3]鸭圆环病毒基因组序列分析及其C1截短基因的原核表达. 施少华,陈珍,杨维星,傅光华,程龙飞,陈红梅,彭春香,黄瑜. 2009

[4]猪繁殖与呼吸综合征病毒Shanxi-6株全基因序列分析. 韩一超,刘文俊,姚敬明,吴忻,王娟萍,武守艳,陈剑波,孟帆,郭慧慧,杨丽华,雷宇平,樊振华. 2014

[5]新型鸭肝炎病毒分离株JFX08全基因组测定与分析. 赵立娜,马秀丽,李玉峰,黄兵,宋敏训,李建亮,崔言顺. 2010

[6]猪圆环病毒2型天津株的全基因组克隆与序列分析. 李海花,李秀丽,张莉,孙英峰,任卫科,路超,田向学. 2014

[7]甘薯曲叶病毒福建省分离物的分子鉴定. 李华伟,刘中华,张鸿,林志坚,李国良,林赵淼,许泳清,邱永祥,罗文彬,纪荣昌,汤浩,邱思鑫. 2018

[8]樱桃谷鸭源鹅出血性多瘤病毒(GHPV)全基因组克隆与分析. 万春和,陈翠腾,刘荣昌,程龙飞,施少华,傅光华,陈红梅,傅秋玲,黄瑜. 2018

[9]猪圆环病毒2型山东株全基因组的克隆与序列分析. 柳美玲,秦晓冰,王爱华,牛晋国,单虎. 2008

[10]三株猪2型圆环病毒甘肃分离株的全基因组序列分析. 马友记,柳纪省,李志勇,殷相平,杨彬,李发弟,张利. 2007

[11]猪Ⅱ型圆环病毒广东分离株的全基因组克隆及序列分析. 王贵平,蒋智勇,宋长绪,高向阳,赵亚华,林志雄,朱道中. 2004

[12]高等植物线粒体基因组测序和序列分析. 李双双,薛龙飞,苏爱国,雷彬彬,王玉美,华金平. 2011

[13]减蛋综合征病毒NE4株全基因组序列测定与分析. 董春娜,李刚,邱文英,张坤,哈小琴. 2010

[14]蓖麻基因组Mlo基因家族成员的鉴定及其序列特征分析. 覃碧,王萌,刘巧玲,张宇. 2014

[15]鸭圆环病毒PT07基因组序列测定与分析. 施少华,傅光华,程龙飞,陈红梅,万春和,陈珍,彭春香,林芳,黄瑜. 2010

[16]一株Asia1型口蹄疫病毒的全基因组序列测定及比较分析. 李爽,李勐,高明春,于力,周国辉,王君伟. 2008

[17]黄瓜绿斑驳花叶病毒安徽分离物全基因组序列测定及分析. 严丹侃,张海珊,郑红英,燕飞,章东方. 2016

[18]兔出血症病毒(RHDV)全基因组克隆与分子流行病学分析. 向华,宣华,隋慧,王贵平,王文成,李尚波,卫广森. 2006

[19]口蹄疫病毒China/99基因组RNA序列测定及比较分析. 张显升,刘在新,赵启组,常惠芸,谢庆阁. 2003

[20]蚕豆萎蔫病毒2号安徽分离物全基因组序列测定与分析. 严丹侃,郑红英,张海珊,沈艳,顾江涛,章东方,燕飞. 2018

作者其他论文 更多>>