中外猪种间生长发育相关的差异候选基因筛选

文献类型： 中文期刊

第一作者： 陶璇

作者： 陶璇;梁艳;杨雪梅;汪勇;杨跃奎;孔繁晶;王言;龚建军;朱康平;卫纪;杨少鹏;吕学斌;顾以韧;何志平

作者机构：

关键词： ACAT1;群体遗传分化指数;基因组重测序;分子育种;猪;SNP

期刊名称： 中国猪业

ISSN： 1673-4645

年卷期： 2024 年 19 卷 001 期

页码： 39-46

摘要： 通过对我国地方猪种与国外猪种比较,筛选与生长发育性状相关的差异候选基因,探索猪种之间生长发育差异的分子机制.分别选择5头内江猪和大约克夏猪进行全基因组重测序,以10 kb滑动窗口和1 kb步长计算群体间遗传分化指数(Fst)平均值,并依据Fst筛选差异SNPs.最终在内江猪与大约克夏猪的比较中分别鉴定出48 924个非同义SNP,它们高度影响2 490个基因.同时,在乙酰辅酶A乙酰转移酶1(ACAT1)、胰岛素样生长因子受体2(IGF2R)和胰岛素样生长因子2 mRNA结合蛋白3(IGF2BP3)基因中检测到3个非同义SNP,这可能影响乙酰辅酶A向乙酰乙酰辅酶A的转化和胰岛素信号通路的正常功能.本研究结果将为探索决定猪表型特征的遗传差异提供基础信息.

分类号： S828

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