3种沼虾的16S rRNA基因序列分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 程起群

作者： 程起群;樊强国;夏连军;黄宁宇

作者机构：

关键词： 沼虾;16SrRNA;测序;遗传差异

期刊名称： 浙江海洋学院学报(自然科学版)

ISSN： 1008-830X

年卷期： 2007 年 26 卷 01 期

页码： 1-5+16

摘要： 为从分子角度理解3种沼虾,即罗氏沼虾、日本沼虾和祁连沼虾的遗传差异,为沼虾资源的管理、保护和合理开发利用提供理论基础,采集了每种沼虾各2尾样本,采用PCR的方法扩增了其线粒体16S rRNA基因片断并测序。比对后共获得了3种沼虾的297 bp的16S rRNA片断序列,共检测到47个变异位点,总变异率为15.8%。3种沼虾的平均碱基含量分别为T(37.7%)、C(10.9%)、A(29.8%)和G(21.6%)。罗氏沼虾种内个体间序列差异为3%。祁连沼虾和日本沼虾种内个体间差异均为0.7%,且两者种间差异很小,为0～0.7%。罗氏沼虾与祁连沼虾、日本沼虾之间的序列差异在13.1%～14.8%之间,种间差异明显。系统进化树显示罗氏沼虾自成一枝,而日本沼虾和祁连沼虾共同构成另一枝,日本沼虾和祁连沼虾的遗传距离小于5%,结果提示日本沼虾和祁连沼虾有很近的亲缘关系,两者也许是亚种关系。

分类号： S917.4

  • 相关文献

[1]三种沼虾的COI基因序列变异及其分类地位探讨(英文). 张凊漪,程起群,管卫兵. 2009

[2]半滑舌鳎致病性荧光假单胞菌的分离鉴定及其感染的病理损伤. 高桂生,张艳英,吉志新,史秋梅,陈娟,高光平,秦凌暄,韩红升,宋青春. 2016

[3]双重PCR快速鉴别无乳链球菌和海豚链球菌. 黎炯,叶星,卢迈新,邓国成,田园园,江小燕,黎坚平. 2010

[4]青岛冬季霾天不同粒径生物气溶胶中细菌群落特征研究. 马曼曼,甄毓,米铁柱,祁建华,邵聪聪,冯文荣. 2017

[5]玉米秸秆与废弃白菜混贮料的发酵特性及其乳酸菌分离鉴定. 任海伟,赵拓,李金平,李雪雁,李志忠,徐娜,王永刚,喻春来,高晓航. 2015

[6]食源性致病菌焦磷酸通用引物测序方法的建立. 赵新,王永,兰青阔,陈锐,朱珠,余景会,李欧静,郭永泽. 2013

[7]气单胞菌和嗜水气单胞菌双重PCR检测方法的建立. 潘晓艺,沈锦玉,郝贵杰,姚嘉贇,徐洋,尹文林,孙逢明,吴颖蕾. 2011

[8]不同大菱鲆(Scophthalmus maximus)个体肠道菌群结构差异研究. 邢孟欣,李贵阳,侯战辉,曲艳梅,刘斌. 2014

[9]粤西镇海湾近江牡蛎线粒体16S rRNA基因序列变异分析. 苏天凤,江世贵,朱彩艳,吴进锋. 2004

[10]水貂奇异变形杆菌的分离鉴定及16SrRNA基因序列分析. 王建科,程悦宁,易立,赵航,林鹏,仝明薇,程世鹏. 2015

[11]基于形态特征和线粒体16S rRNA基因序列探讨棱鳀属的系统进化. 马春艳,马凌波,倪勇,沈盎绿,张永. 2010

[12]斜带石斑鱼病原菌(哈维氏弧菌)的分离与鉴定. 陈献稿,吴淑勤,石存斌,李宁求. 2004

[13]甲维盐对斜纹夜蛾幼虫肠道细菌的影响. 张靳宜,吕宝乾,杨帆,何杏,卢辉,唐继洪,梁文豪. 2019

[14]山西猪链球菌的分离鉴定及药敏实验. 唐娟,刘华栋,王彩先,陆冰洋,詹海杰,詹丽娥. 2014

[15]狼源产气荚膜梭菌的分离鉴定及分子分型. 董秀梅,李秀云,刘念,杨巍,邓爱怀,吕文鹏,关春宇,张萍,邹希明,师东方. 2022

[16]嘉陵江合川段秋季微生物多样性研究. 但言,沈子伟,余凤琴,张闯,倪朝辉,黎春. 2019

[17]1株产纤维素细菌的初步鉴定. 石晓珍,杨腊英,黄华平,袁宏伟,张艳玲,黄俊生. 2008

[18]从湖羊肺脏中分离绵羊肺炎支原体的鉴定. 李媛,陶岳,阿依吐拉·肉孜,高玉龙,尹训南,李新萍,张孝恩,王砚范,辛九庆. 2006

[19]鳗肺炎克雷伯菌的分离与鉴定. 邓国成,罗霞,江小燕,刘礼辉,林明辉,彭勇鳌,廖国礼. 2009

[20]基于16SrRNA部分序列探讨中国近海十三种石首鱼类的分子系统进化关系. 张永,马春艳,马凌波,倪勇,沈盎绿. 2010

作者其他论文 更多>>

微信小程序