长三角地区兼用型鸭全基因组遗传多样性分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 章双杰

作者： 章双杰;王靖;杨建生;李慧芳;宋卫涛;许金根;华国浩;叶彩芳;林雨鑫;刘怡

作者机构：

关键词： 长三角地区;鸭;全基因组;重测序;系统进化树;拷贝数变异

期刊名称： 江苏农业科学

ISSN： 1002-1302

年卷期： 2017 年 45 卷 17 期

页码： 32-35

收录情况： 北大核心

摘要： 为了全面了解长三角地区兼用型鸭的遗传多样性,对该地区娄门鸭、昆山麻鸭、巢湖鸭和高邮鸭的血液进行全基因组重测序分析。4个样本平均的测序深度和覆盖率分别为11.91×、97.19%;通过与北京鸭的基因组进行比对,娄门鸭、昆山麻鸭、巢湖鸭和高邮鸭分别检测到7 733 429、8 161 310、7 324 728、7 986 534个SNP,1 145 846、1 239 348、958 379、1 121 697个Indel以及1 777、1 949、1 556、1 088个CNV,这些变异大部分坐落在基因间或基因内的内含子区;通过群体系统进化树分析和CNV交集分析发现娄门鸭和昆山麻鸭为一类,巢湖鸭和高邮鸭为一类。

分类号： S834.2

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