木薯NHX基因家族鉴定及特征分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 杨仕梅

作者： 杨仕梅;谢恩俊;罗春芳;饶萍;欧珍贵;杨龙

作者机构：

关键词： 木薯;NHX家族;系统进化;保守结构;蛋白互作;基因鉴定

期刊名称： 贵州农业科学

ISSN： 1001-3601

年卷期： 2024 年 008 期

页码： 19-26

收录情况： 北大核心

摘要： 【目的】鉴定木薯NHX基因家族成员并分析特征，为研究木薯耐盐新种质和挖掘木薯抗逆特性基因具有重要意义。【方法】基于全基因组水平上对木薯NHX基因家族进行鉴定，对其系统进化树、蛋白理化性质、保守结构、保守基序、共线性、蛋白互作等进行分析。【结果】在木薯中共鉴定到9条MeNHX基因（MeNHX1～MeNHX9），分为3个亚族，且不均匀地分布在7条染色体上，其中，染色体Chr03和Chr15中均包含2条MeNHX基因，染色体Chr01、Chr08、Chr09、Chr10和Chr17均只有1条MeNHX基因。MeNHX蛋白有520～1 157个氨基酸，其相对分子质量为58.09～128.21 kDa，理论等电点为5.63～9.11；为两性蛋白，不稳定系数为34.60～41.34；为疏水性蛋白，其GRAVY为0.094～0.595。9条MeNHX基因均含有典型的Na+/H+保守结构域，木薯NHX存在多个共线性区块，进化压力Ka/Ks值均小于1，主要受纯化选择作用；含有光响应、生物胁迫及非生物胁迫作用相关元件MeNHX基因同多条离子通道基因存在蛋白互作关系。【结论】MeNHX基因在木薯受到光、生物胁迫和非生物胁迫时参与生长发育过程，以适应其环境变化。

分类号： S533

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