3株鸭肝炎病毒1型全基因序列分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 杨维星

作者： 杨维星;施少华;陈红梅;万春和;程龙飞;傅光华;林芳;林建生;苏敬良;黄瑜

作者机构：

关键词： 鸭肝炎病毒1型;基因组;序列分析

期刊名称： 中国农学通报

ISSN： 1000-6850

年卷期： 2010 年 26 卷 14 期

页码： 8-12

收录情况： 北大核心

摘要： 为分析3株1型鸭肝炎病毒(DHV)的遗传变异和进化关系;采用RT-PCR和5'-/3'-RACE.方法测定3株1型鸭肝炎病毒全基因序列;研究结果表明,不含poly(A)尾巴的3株病毒的基因组全长为7691~7700nt,基因组均仅含一个长度为6750nt的ORF,625~627nt5'端非翻译区和325~328nt3'端非翻译区(UTR)。将3株病毒株与GeneBank公布的其他DHV-1全基因序列及小RNA病毒科的其他属代表病毒株进行序列分析表明,聚蛋白均被分割成为12个蛋白,其中VP1的变异性最大,180~187位为高变区。3株病毒与DHV-1参考毒株核苷酸序列同源性在93.7%~98.8%,氨基酸序列同源性在96.9%~98.8%,DHV-1各株在小RNA科病毒多聚蛋白氨基酸序列进化树上形成一个独立的进化分支;DHVs-1病毒间核苷酸和氨基酸仍较保守,它们在进化中可将其归为小RNA病毒科的一个新属。

分类号： S852.659.6

  • 相关文献

[1]鸭圆环病毒基因组序列分析及其C1截短基因的原核表达. 施少华,陈珍,杨维星,傅光华,程龙飞,陈红梅,彭春香,黄瑜. 2009

[2]猪繁殖与呼吸综合征病毒Shanxi-6株全基因序列分析. 韩一超,刘文俊,姚敬明,吴忻,王娟萍,武守艳,陈剑波,孟帆,郭慧慧,杨丽华,雷宇平,樊振华. 2014

[3]新型鸭肝炎病毒分离株JFX08全基因组测定与分析. 赵立娜,马秀丽,李玉峰,黄兵,宋敏训,李建亮,崔言顺. 2010

[4]猪圆环病毒2型天津株的全基因组克隆与序列分析. 李海花,李秀丽,张莉,孙英峰,任卫科,路超,田向学. 2014

[5]甘薯曲叶病毒福建省分离物的分子鉴定. 李华伟,刘中华,张鸿,林志坚,李国良,林赵淼,许泳清,邱永祥,罗文彬,纪荣昌,汤浩,邱思鑫. 2018

[6]樱桃谷鸭源鹅出血性多瘤病毒(GHPV)全基因组克隆与分析. 万春和,陈翠腾,刘荣昌,程龙飞,施少华,傅光华,陈红梅,傅秋玲,黄瑜. 2018

[7]猪圆环病毒2型山东株全基因组的克隆与序列分析. 柳美玲,秦晓冰,王爱华,牛晋国,单虎. 2008

[8]三株猪2型圆环病毒甘肃分离株的全基因组序列分析. 马友记,柳纪省,李志勇,殷相平,杨彬,李发弟,张利. 2007

[9]猪Ⅱ型圆环病毒广东分离株的全基因组克隆及序列分析. 王贵平,蒋智勇,宋长绪,高向阳,赵亚华,林志雄,朱道中. 2004

[10]高等植物线粒体基因组测序和序列分析. 李双双,薛龙飞,苏爱国,雷彬彬,王玉美,华金平. 2011

[11]减蛋综合征病毒NE4株全基因组序列测定与分析. 董春娜,李刚,邱文英,张坤,哈小琴. 2010

[12]蓖麻基因组Mlo基因家族成员的鉴定及其序列特征分析. 覃碧,王萌,刘巧玲,张宇. 2014

[13]猪嵴病毒福建株全基因克隆及序列分析. 修金生,胡崇伟,陈如敬,王斌,李涛,陈秋勇,林群群. 2013

[14]鸭圆环病毒PT07基因组序列测定与分析. 施少华,傅光华,程龙飞,陈红梅,万春和,陈珍,彭春香,林芳,黄瑜. 2010

[15]一株Asia1型口蹄疫病毒的全基因组序列测定及比较分析. 李爽,李勐,高明春,于力,周国辉,王君伟. 2008

[16]黄瓜绿斑驳花叶病毒安徽分离物全基因组序列测定及分析. 严丹侃,张海珊,郑红英,燕飞,章东方. 2016

[17]兔出血症病毒(RHDV)全基因组克隆与分子流行病学分析. 向华,宣华,隋慧,王贵平,王文成,李尚波,卫广森. 2006

[18]口蹄疫病毒China/99基因组RNA序列测定及比较分析. 张显升,刘在新,赵启组,常惠芸,谢庆阁. 2003

[19]蚕豆萎蔫病毒2号安徽分离物全基因组序列测定与分析. 严丹侃,郑红英,张海珊,沈艳,顾江涛,章东方,燕飞. 2018

[20]果子狸源呼肠孤病毒MPC/04株全基因组序列测定与分析. 邵昱昊,韩宗玺,李慧昕,孔宪刚,刘胜旺. 2010

作者其他论文 更多>>

微信小程序